Treceți la conținut
Folosiți fondurile HSA sau FSA
Secvențiați-vă genomul (se deschide într-un filă nouă)

Genă

HMGB1

high mobility group box 1

Rezumat

Localizare citogenetică
13q12.3
Coordonate
Cromozomul 13: 30.456.704–30.465.936 (GRCh38)
Exoni
5 de exoni pe 9,2 kb
Proteină
215 de aminoacizi
Denumiri alternative
HMG3, SBP-1, DKFZp686A04236
Simboluri anterioare
HMG1
Transcriptul MANE Select
ENST00000341423.10NM_002128.7
Tip de locus
gene with protein product
  • Foarte ridicată
  • Ridicată
  • Scăzută
  • Foarte scăzută

Rapoarte curatoriate relevante pentru această genă

Niciun raport Genome Test nu citește încă HMGB1. Testul secvențiază întregul dumneavoastră genom, deci datele dumneavoastră includ totuși și această genă.

Structura genei HMGB1

  • Secvență codificatoare
  • Regiune netranslată
  • Intron
  • Sensul transcripției
  • Situri cunoscute asociate bolilor
  • Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Cromozomul 13, cu o paranteză în locul unde se află HMGB1. HMGB1 și încă 6 de gene în apropiere, pe cromozomul 13, între 29.961.320 și 30.961.319.Cromozomul 1313q12.3p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3430 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 Mb30,8 MbKATNAL1: 30.202.630–30.307.554, catena inversăKATNAL1UBE2L5: 30.422.488–30.429.758, catena directăUBE2L5HMGB1: 30.456.704–30.465.936, catena inversăHMGB1USPL1: 30.617.693–30.660.770, catena directăUSPL1ALOX5AP: 30.713.478–30.765.072, catena directăALOX5APMEDAG: 30.906.200–30.925.574, catena directăMEDAGTEX26: 30.932.639–30.982.522, catena directăTEX26Diagrama genei HMGB1: 5 exoni pe catena inversă a cromozomului 13Exonul 5: 1 sit cunoscut asociat unei boliExonul 4: 1 sit cunoscut asociat unei boliExon 5: 30.456.704–30.461.533, 4.830 de bazeExon 4: 30.462.538–30.462.712, 175 de bazeExon 3: 30.463.207–30.463.352, 146 de bazeExon 2: 30.463.531–30.463.694, 164 de bazeExon 1: 30.465.796–30.465.936, 141 de baze543215′3′

Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.

Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).

Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.

Exonii reprezintă 5,5 kb din cei 9,2 kb ai genei; 648 dintre aceste baze codifică proteina.

Secvențierea HMGB1

2

poziții în HMGB1 unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă

2 dintre ele (100 %) se află în regiuni pe care citirile scurte le identifică greu.

  • Low mappability (1 sit)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 sit)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Un genom întreg acoperă toate cele 9,2 kb din HMGB1, inclusiv intronii, nu doar cei 5,5 kb de exoni.

Legături externe

De unde provin acestea

  • HGNC: simbolul genei, numele, alte simboluri și localizarea.
  • MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
  • ClinVar și stratificările GIAB: locurile cunoscute asociate bolilor și regiunile pe care citirile scurte le consideră dificile.
  • Versiunea datelor 2026.10.16-c6eea6bf.

Citează această pagină

APA

Dante Labs. (s.a.). Gena HMGB1: high mobility group box 1. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/hmgb1

Vancouver

Dante Labs. Gena HMGB1: high mobility group box 1 [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/hmgb1

Un test. Răspunsuri pentru o viață.

De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni

Comandați Genome Test-ul meu