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Gen

HMGB1

high mobility group box 1

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
13q12.3
Koordinaten
Chromosom 13: 30.456.704–30.465.936 (GRCh38)
Exons
5 Exons über 9,2 kb
Protein
215 Aminosäuren
Auch bekannt als
HMG3, SBP-1, DKFZp686A04236
Frühere Symbole
HMG1
MANE-Select-Transkript
ENST00000341423.10NM_002128.7
Locus-Typ
gene with protein product
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet HMGB1 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von HMGB1

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Bekannte krankheitsverursachende Stellen
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 13, mit einer Klammer, an der HMGB1 liegt. HMGB1 und 6 Gene in der Nähe auf Chromosom 13, von 29.961.320 bis 30.961.319.Chromosom 1313q12.3p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3430 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 Mb30,8 MbKATNAL1: 30.202.630–30.307.554, Minus-StrangKATNAL1UBE2L5: 30.422.488–30.429.758, Plus-StrangUBE2L5HMGB1: 30.456.704–30.465.936, Minus-StrangHMGB1USPL1: 30.617.693–30.660.770, Plus-StrangUSPL1ALOX5AP: 30.713.478–30.765.072, Plus-StrangALOX5APMEDAG: 30.906.200–30.925.574, Plus-StrangMEDAGTEX26: 30.932.639–30.982.522, Plus-StrangTEX26Diagramm von HMGB1: 5 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 13Exon 5: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 4: 1 bekannte krankheitsverursachende StelleExon 5: 30.456.704–30.461.533, 4.830 BasenExon 4: 30.462.538–30.462.712, 175 BasenExon 3: 30.463.207–30.463.352, 146 BasenExon 2: 30.463.531–30.463.694, 164 BasenExon 1: 30.465.796–30.465.936, 141 Basen543215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 5,5 kb der 9,2 kb des Gens aus; 648 dieser Basen kodieren für das Protein.

So liest ein Gentest HMGB1

2

Positionen in HMGB1, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft

2 davon (100 %) liegen in Bereichen, die Short Reads schwer erfassen.

  • Low mappability (1 Stelle)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 Stelle)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 9,2 kb von HMGB1, einschließlich der Introns, und nicht nur die 5,5 kb Exons.

Externe Links

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
  • Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). HMGB1-Gen: high mobility group box 1. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/hmgb1

Vancouver

Dante Labs. HMGB1-Gen: high mobility group box 1 [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/hmgb1

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