Pereiti prie turinio
Naudokite savo HSA ar FSA lėšas
Sekvenuokite savo genomą (atsidaro naujame skirtuke)

Genas

HMGB1

high mobility group box 1

Santrauka

Citogenetinė vieta
13q12.3
Koordinatės
Chromosoma 13: 30 456 704–30 465 936 (GRCh38)
Eksonai
5 eksonų per 9,2 kb
Baltymas
215 aminorūgščių
Taip pat žinomas kaip
HMG3, SBP-1, DKFZp686A04236
Ankstesni simboliai
HMG1
MANE Select transkriptas
ENST00000341423.10NM_002128.7
Lokuso tipas
gene with protein product
  • Labai aukštas
  • Patikimas
  • Žemas
  • Labai žemas

Kuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu

Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito HMGB1 geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.

Kaip išdėstytas HMGB1

  • Koduojanti seka
  • Netransliuojama sritis
  • Intronas
  • Transkripcijos kryptis
  • Žinomos su liga susijusios vietos
  • Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Chromosoma 13, su skliaustu, kur yra HMGB1. HMGB1 ir dar 6 genų šalia jo chromosomoje 13, nuo 29 961 320 iki 30 961 319.Chromosoma 1313q12.3p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3430 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 Mb30,8 MbKATNAL1: 30 202 630–30 307 554, atvirkštinė grandinėKATNAL1UBE2L5: 30 422 488–30 429 758, tiesioginė grandinėUBE2L5HMGB1: 30 456 704–30 465 936, atvirkštinė grandinėHMGB1USPL1: 30 617 693–30 660 770, tiesioginė grandinėUSPL1ALOX5AP: 30 713 478–30 765 072, tiesioginė grandinėALOX5APMEDAG: 30 906 200–30 925 574, tiesioginė grandinėMEDAGTEX26: 30 932 639–30 982 522, tiesioginė grandinėTEX26HMGB1 diagrama: 5 eksonų, chromosoma 13, atvirkštinė grandisEkson 5: 1 žinoma su liga susijusi vietaEkson 4: 1 žinoma su liga susijusi vietaEksonas 5: 30 456 704–30 461 533, 4 830 baziųEksonas 4: 30 462 538–30 462 712, 175 baziųEksonas 3: 30 463 207–30 463 352, 146 baziųEksonas 2: 30 463 531–30 463 694, 164 baziųEksonas 1: 30 465 796–30 465 936, 141 bazė543215′3′

Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.

Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).

Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.

Eksonai sudaro 5,5 kb iš 9,2 kb geno; 648 šių bazių koduoja baltymą.

Sekvenavimas: HMGB1

2

vietos geno HMGB1 sekoje, kuriose ClinVar pakitimus klasifikuoja kaip patogeninius arba tikriausiai patogeninius

Iš jų 2 (100 %) patenka į sritis, kuriose trumpais skaitiniais sunku nustatyti.

  • Low mappability (1 vieta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 vieta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Viso genomo sekvenavimas apima visus 9,2 kb geno HMGB1, įskaitant intronus, o ne tik 5,5 kb eksonų.

Išorinės nuorodos

Iš kur tai

  • HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
  • MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
  • ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
  • Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.

Cituoti šį puslapį

APA

Dante Labs. (be datos). HMGB1 genas: high mobility group box 1. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/hmgb1

Vancouver

Dante Labs. HMGB1 genas: high mobility group box 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/hmgb1

Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.

Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites

Įsigyti savo Genome Test