Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA

Gen

HMGB1

high mobility group box 1

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
13q12.3
Koordinater
Kromosom 13: 30 456 704–30 465 936 (GRCh38)
Eksoner
5 eksoner over 9,2 kb
Protein
215 aminosyrer
Også kjent som
HMG3, SBP-1, DKFZp686A04236
Tidligere symboler
HMG1
MANE Select-transkripsjon
ENST00000341423.10NM_002128.7
Lokustype
gene with protein product
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

ReferansegenomGRCh38

Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser HMGB1 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er HMGB1 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 13, med en parentes der HMGB1 står. HMGB1 og 6 gener i nærheten på kromosom 13, fra 29 961 320 til 30 961 319.Kromosom 1313q12.3p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3430 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 Mb30,8 MbKATNAL1: 30 202 630–30 307 554, bakover-strengKATNAL1UBE2L5: 30 422 488–30 429 758, fremover-strengUBE2L5HMGB1: 30 456 704–30 465 936, bakover-strengHMGB1USPL1: 30 617 693–30 660 770, fremover-strengUSPL1ALOX5AP: 30 713 478–30 765 072, fremover-strengALOX5APMEDAG: 30 906 200–30 925 574, fremover-strengMEDAGTEX26: 30 932 639–30 982 522, fremover-strengTEX26Diagram av HMGB1: 5 eksoner på bakover-strengen til kromosom 13Ekson 5: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 4: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 5: 30 456 704–30 461 533, 4 830 baserEkson 4: 30 462 538–30 462 712, 175 baserEkson 3: 30 463 207–30 463 352, 146 baserEkson 2: 30 463 531–30 463 694, 164 baserEkson 1: 30 465 796–30 465 936, 141 baser543215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 5,5 kb av genets 9,2 kb, og 648 av disse basene koder for proteinet.

Slik leser en genetisk test HMGB1

2

posisjoner i HMGB1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen

2 av dem (100 %) faller i områder som korte avlesninger sliter med.

  • Low mappability (1 posisjon)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 posisjon)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

En helgenomsekvensering dekker alle 9,2 kb av HMGB1, inkludert introner, og ikke bare de 5,5 kb med eksoner.

Hvor dette kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
  • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
  • Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). HMGB1-genet: high mobility group box 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/hmgb1

Vancouver

Dante Labs. HMGB1-genet: high mobility group box 1 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/hmgb1

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test