Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

HMGB1

high mobility group box 1

Sammanfattning

Cytogenetisk position
13q12.3
Koordinater
Kromosom 13: 30 456 704–30 465 936 (GRCh38)
Exoner
5 exoner på 9,2 kb
Protein
215 aminosyror
Även känd som
HMG3, SBP-1, DKFZp686A04236
Tidigare symboler
HMG1
MANE Select-transkript
ENST00000341423.10NM_002128.7
Lokustyp
gene with protein product
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser HMGB1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är HMGB1 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 13, med en parentes där HMGB1 finns. HMGB1 och 6 gener i närheten på kromosom 13, från 29 961 320 till 30 961 319.Kromosom 1313q12.3p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3430 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 Mb30,8 MbKATNAL1: 30 202 630–30 307 554, bakåt-strängKATNAL1UBE2L5: 30 422 488–30 429 758, framåt-strängUBE2L5HMGB1: 30 456 704–30 465 936, bakåt-strängHMGB1USPL1: 30 617 693–30 660 770, framåt-strängUSPL1ALOX5AP: 30 713 478–30 765 072, framåt-strängALOX5APMEDAG: 30 906 200–30 925 574, framåt-strängMEDAGTEX26: 30 932 639–30 982 522, framåt-strängTEX26Diagram över HMGB1: 5 exoner på bakåt-strängen av kromosom 13Exon 5: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 4: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 5: 30 456 704–30 461 533, 4 830 baserExon 4: 30 462 538–30 462 712, 175 baserExon 3: 30 463 207–30 463 352, 146 baserExon 2: 30 463 531–30 463 694, 164 baserExon 1: 30 465 796–30 465 936, 141 baser543215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 5,5 kb av genens 9,2 kb, och 648 av dessa baser kodar för proteinet.

Så läser ett genomtest HMGB1

2

positioner i HMGB1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

2 av dem (100 %) ligger i områden som korta läsningar har svårt för.

  • Low mappability (1 ställe)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 ställe)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

En helgenomsanalys täcker alla 9,2 kb av HMGB1, med introner inräknade, inte bara de 5,5 kb exoner.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). HMGB1-genen: high mobility group box 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/hmgb1

Vancouver

Dante Labs. HMGB1-genen: high mobility group box 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/hmgb1

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test