İçeriğe atla
HSA veya FSA fonlarınızı kullanın

Gen

HMGB1

high mobility group box 1

Özet

Sitogenetik konum
13q12.3
Koordinatlar
Kromozom 13: 30.456.704–30.465.936 (GRCh38)
Eksonlar
9,2 kb boyunca 5 ekson
Protein
215 amino asit
Diğer adları
HMG3, SBP-1, DKFZp686A04236
Önceki semboller
HMG1
MANE Select transkripti
ENST00000341423.10NM_002128.7
Lokus türü
gene with protein product
  • Çok yüksek
  • Yüksek
  • Düşük
  • Çok düşük

Referans genomGRCh38

Gen ve varyant sayfalarındaki konumlar, bu tarayıcıda yaptığınız bu seçimi izler.

Bu gen için derlenmiş ilgili raporlar

Hiçbir Genome Test raporu HMGB1 genini henüz okumuyor. Test tüm genomunuzu dizilediği için bu gen yine de verilerinize dahildir.

HMGB1 geninin yapısı

  • Kodlayan dizi
  • Çevrilmeyen bölge
  • İntron
  • Transkripsiyon yönü
  • Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
  • Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Kromozom 13, HMGB1 genin yerini gösteren köşeli parantezle. HMGB1 ve yakınındaki 6 gen, kromozom 13 üzerinde, 29.961.320 ile 30.961.319 arasında.Kromozom 1313q12.3p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3430 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 Mb30,8 MbKATNAL1: 30.202.630–30.307.554, geri iplikKATNAL1UBE2L5: 30.422.488–30.429.758, ileri iplikUBE2L5HMGB1: 30.456.704–30.465.936, geri iplikHMGB1USPL1: 30.617.693–30.660.770, ileri iplikUSPL1ALOX5AP: 30.713.478–30.765.072, ileri iplikALOX5APMEDAG: 30.906.200–30.925.574, ileri iplikMEDAGTEX26: 30.932.639–30.982.522, ileri iplikTEX26HMGB1 şeması: kromozom 13 üzerinde geri yönde 5 eksonEkzon 5: 1 bilinen hastalığa yol açan bölgeEkzon 4: 1 bilinen hastalığa yol açan bölgeEkson 5: 30.456.704–30.461.533, 4.830 bazEkson 4: 30.462.538–30.462.712, 175 bazEkson 3: 30.463.207–30.463.352, 146 bazEkson 2: 30.463.531–30.463.694, 164 bazEkson 1: 30.465.796–30.465.936, 141 baz543215′3′

Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.

Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).

Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.

Ekzonlar genin 9,2 kb uzunluğunun 5,5 kb'sini oluşturur; bu bazların 648 tanesi proteini kodlar.

Bir genom testi HMGB1 genini nasıl okur

2

HMGB1 içinde, ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı konumlar

Bunların 2 tanesi (%100), kısa okumaların zorlandığı bölgelere düşüyor.

  • Low mappability (1 konum)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 konum)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Tam genom, HMGB1 genindeki 9,2 kb'lik bölgenin tamamını kapsar; yalnızca 5,5 kb'lik ekzonları değil, intronlar da dahil olmak üzere.

Bilgilerin kaynağı

  • HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
  • NCBI ve EMBL-EBI'dan MANE Select v1.5: transkript, eksonları ve kodlayıcı dizisi.
  • ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı bölgeler.
  • Veri sürümü 2026.10.16-c6eea6bf.

Bu sayfayı alıntıla

APA

Dante Labs. (t.y.). HMGB1 geni: high mobility group box 1. Erişim tarihi: 17 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/hmgb1

Vancouver

Dante Labs. HMGB1 geni: high mobility group box 1 [Internet]. [alıntı tarihi 17 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/hmgb1

Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.

$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde

Genome Test'imi al