Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

HMGB1

high mobility group box 1

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
13q12.3
Współrzędne
Chromosom 13: 30 456 704–30 465 936 (GRCh38)
Eksony
5 eksonów na odcinku 9,2 kb
Białko
215 aminokwasów
Znany również jako
HMG3, SBP-1, DKFZp686A04236
Poprzednie symbole
HMG1
Transkrypt MANE Select
ENST00000341423.10NM_002128.7
Typ locus
Protein-coding
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu HMGB1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu HMGB1

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Znane miejsca powodujące choroby
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 13, z nawiasem wskazującym położenie HMGB1. HMGB1 i 6 genów w pobliżu na chromosomie 13, od 29 961 320 do 30 961 319.Chromosom 1313q12.3p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3430 Mb30,2 Mb30,4 Mb30,6 Mb30,8 MbKATNAL1: 30 202 630–30 307 554, nić ujemnejKATNAL1UBE2L5: 30 422 488–30 429 758, nić dodatniejUBE2L5HMGB1: 30 456 704–30 465 936, nić ujemnejHMGB1USPL1: 30 617 693–30 660 770, nić dodatniejUSPL1ALOX5AP: 30 713 478–30 765 072, nić dodatniejALOX5APMEDAG: 30 906 200–30 925 574, nić dodatniejMEDAGTEX26: 30 932 639–30 982 522, nić dodatniejTEX26Schemat HMGB1: 5 eksonów na nici ujemnej chromosomu 13Ekson 5: 1 znane miejsce powodujące chorobęEkson 4: 1 znane miejsce powodujące chorobęEkson 5: 30 456 704–30 461 533, 4830 zasadEkson 4: 30 462 538–30 462 712, 175 zasadEkson 3: 30 463 207–30 463 352, 146 zasadEkson 2: 30 463 531–30 463 694, 164 zasadEkson 1: 30 465 796–30 465 936, 141 zasad543215′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 5,5 kb z 9,2 kb genu; 648 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie HMGB1

2

pozycje w genie HMGB1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną

2 z nich (100%) przypada na regiony, w których krótkie odczyty mają trudności.

  • Low mappability (1 miejsce)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (1 miejsce)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 9,2 kb genu HMGB1, łącznie z intronami, a nie tylko 5,5 kb eksonów.

Linki zewnętrzne

Skąd pochodzą te dane

  • HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
  • Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen HMGB1: high mobility group box 1. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/hmgb1

Vancouver

Dante Labs. Gen HMGB1: high mobility group box 1 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/hmgb1

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test