Geen
CFAP54
cilia and flagella associated protein 54
- HGNC 26456↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000188596↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 144535↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 12q23.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 12: 96 489 577–96 875 555 (GRCh38)
- Eksonid
- 68 eksonit, ulatus 386 kb
- Valk
- 3096 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- FLJ31514, FLJ44112
- Varasemad tähised
- C12orf63, C12orf55
- MANE Select transkript
- ENST00000524981.9NM_001306084.2
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe CFAP54 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Primaarne tsiliaarne düskineesia
- Autosoomne retsessiivne
Haruldane, geneetiliselt heterogeenne, peamiselt hingamisteede haigus, mida iseloomustavad kroonilised ülemiste ja alumiste hingamisteede haigused. Ligikaudu pooltel PCD-patsientidest esineb elundite lateraalsuse häire (situs inversus totalis või situs ambiguus/heterotaksia).
- ClinGen hindab seost järgmiselt: tugev
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas CFAP54 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 9,8 kb kogupikkusega 386 kb; neist 9291 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse CFAP54
3
kohad geenis CFAP54, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CFAP54 386 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (9,8 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- CCDC39coiled-coil domain 39 molecular ruler complex subunitJagab 1 haigust
- CCDC40coiled-coil domain 40 molecular ruler complex subunitJagab 1 haigust
- CCNOcyclin OJagab 1 haigust
- CENPFcentromere protein FJagab 1 haigust
- CFAP20DCCFAP20 domain containingJagab 1 haigust
- CFAP221cilia and flagella associated protein 221Jagab 1 haigust
- CFAP298cilia and flagella associated protein 298Jagab 1 haigust
- CFAP300cilia and flagella associated protein 300Jagab 1 haigust
- CLXNcalaxinJagab 1 haigust
- DAW1dynein assembly factor with WD repeats 1Jagab 1 haigust
- DNAAF1dynein axonemal assembly factor 1Jagab 1 haigust
- DNAAF11dynein axonemal assembly factor 11Jagab 1 haigust
Geeniga CFAP54 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida CFAP54 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). CFAP54 geen: cilia and flagella associated protein 54. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/cfap54
Dante Labs. CFAP54 geen: cilia and flagella associated protein 54 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/cfap54
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast