Gen
SLC10A7
solute carrier family 10 member 7
- HGNC 23088↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000120519↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 84068↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 4q31.22
- Koordinater
- Kromosom 4: 146 253 981–146 521 940 (GRCh38)
- Exoner
- 12 exoner på 268 kb
- Protein
- 340 aminosyror
- Även känd som
- MGC25043, DKFZp566M114, DKFZp313H0531, DKFZp779O2438
- Tidigare symboler
- C4orf13
- MANE Select-transkript
- ENST00000335472.12NM_001029998.6
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc10a7.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SLC10A7, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser SLC10A7 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är SLC10A7 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,8 kb av genens 268 kb, och 1 023 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SLC10A7
2Låg
Hur svår SLC10A7 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av SLC10A7s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.7,4 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.11 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
1
position i SLC10A7 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 268 kb av SLC10A7, inklusive introner, inte bara de 3,8 kb exoner.
Egenskaper kopplade till SLC10A7
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SLC10A7 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Double-Jointed
- Scoliosis
- Coronal cleft vertebrae
- Irregular vertebral endplates
- Advanced bone age
- Flat end part of bone
- Kyphoscoliosis
- Prominent swayback
Visa ytterligare 4 egenskaper
Abnormality of head or neck
- Amelogenesis imperfecta
- Thin dental enamel
- Little lower jaw
- Dental cavities
- Big lower jaw
- Cleft palate
- Decreased number of teeth
- Pierre-Robin sequence
Visa ytterligare 3 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SLC10A7-genen: solute carrier family 10 member 7. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/slc10a7
Dante Labs. SLC10A7-genen: solute carrier family 10 member 7 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/slc10a7
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor