Gen
BTG4
BTG anti-proliferation factor 4
- HGNC 13862↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000137707↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 54766↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 11q23.1
- Koordinater
- Kromosom 11: 111 494 815–111 512 386 (GRCh38)
- Exoner
- 5 exoner på 17,6 kb
- Protein
- 229 aminosyror
- Även känd som
- PC3B, APRO3
- MANE Select-transkript
- ENST00000692032.1NM_001367975.1
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/btg4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs BTG4, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Kvinnlig infertilitet
- ärftlig defekt i oocytmognaden
- 2 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
Så är BTG4 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,2 kb av genens 17,6 kb, och 690 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av BTG4
1Låg
Hur svår BTG4 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av BTG4s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.1,1 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.8,7 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
2
positioner i BTG4 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 17,6 kb av BTG4, inklusive introner, inte bara de 1,2 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- CDC20cell division cycle 20Delar 1 tillstånd
- KPNA7karyopherin subunit alpha 7Delar 1 tillstånd
- MOSMOS proto-oncogene, serine/threonine kinaseDelar 1 tillstånd
- NLRP2NLR family pyrin domain containing 2Delar 1 tillstånd
- NLRP5NLR family pyrin domain containing 5Delar 1 tillstånd
- PADI6peptidyl arginine deiminase 6Delar 1 tillstånd
- PANX1pannexin 1Delar 1 tillstånd
- PATL2PAT1 homolog 2Delar 1 tillstånd
- REC114REC114 meiotic recombination proteinDelar 1 tillstånd
- TRIP13thyroid hormone receptor interactor 13Delar 1 tillstånd
- TUBA4Atubulin alpha 4aDelar 1 tillstånd
- TUBB8tubulin beta 8 class VIIIDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till BTG4
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som BTG4 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). BTG4-genen: BTG anti-proliferation factor 4. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/btg4
Dante Labs. BTG4-genen: BTG anti-proliferation factor 4 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/btg4
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor