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Gene

SPNS2

SPNS lysolipid transporter 2, sphingosine-1-phosphate

Resumo

Localização citogenética
17p13.2
Coordenadas
Cromossoma 17: 4 498 881–4 539 035 (GRCh38)
Exões
13 exões ao longo de 40,2 kb
Proteína
549 aminoácidos
Também conhecido como
SLC63A2
Transcrito MANE Select
ENST00000329078.8NM_001124758.3
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Genoma de referênciaGRCh38

As posições nas páginas de genes e variantes seguem esta escolha, neste navegador.

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa SPNS2 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como SPNS2 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Locais conhecidos associados a doença
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 17, com um parêntese onde se situa SPNS2. SPNS2 e 32 genes próximos no cromossoma 17, de 4 018 958 a 5 018 957.Cromossoma 1717p13.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.34,2 Mb4,4 Mb4,6 Mb4,8 Mb5 MbZZEF1: 4 004 432–4 143 628, fita inversaZZEF1CYB5D2: 4 143 168–4 188 683, fita diretaCYB5D2ANKFY1: 4 163 821–4 263 995, fita inversaANKFY1UBE2G1: 4 269 221–4 366 678, fita inversaUBE2G1SPNS3: 4 433 940–4 488 208, fita diretaSPNS3SPNS2: 4 498 881–4 539 035, fita diretaSPNS2MYBBP1A: 4 538 897–4 555 403, fita inversaMYBBP1AGGT6: 4 556 342–4 560 818, fita inversaGGT6SMTNL2: 4 583 999–4 608 798, fita diretaSMTNL2ALOX15: 4 629 736–4 642 294, fita inversaALOX15PELP1: 4 669 774–4 704 337, fita inversaPELP1ARRB2: 4 710 393–4 721 500, fita diretaARRB2MED11: 4 731 411–4 733 610, fita diretaMED11CXCL16: 4 732 915–4 740 064, fita inversaCXCL16ZMYND15: 4 739 108–4 746 119, fita diretaTM4SF5: 4 771 835–4 783 220, fita diretaTM4SF5VMO1: 4 785 281–4 790 406, fita inversaVMO1GLTPD2: 4 788 927–4 790 734, fita diretaGLTPD2PSMB6: 4 796 144–4 798 503, fita diretaPSMB6C17orf114: 4 801 159–4 807 013, fita inversaPLD2: 4 807 074–4 823 434, fita diretaMINK1: 4 833 147–4 898 065, fita diretaMINK1CHRNE: 4 897 769–4 934 438, fita inversaCHRNEC17orf107: 4 899 418–4 902 934, fita diretaC17orf107GP1BA: 4 932 261–4 935 023, fita diretaGP1BASLC25A11: 4 934 570–4 940 156, fita inversaSLC25A11RNF167: 4 939 997–4 945 223, fita diretaPFN1: 4 945 652–4 950 517, fita inversaENO3: 4 948 034–4 957 132, fita diretaSPAG7: 4 959 226–4 967 835, fita inversaCAMTA2: 4 967 992–4 987 684, fita inversaINCA1: 4 988 130–4 999 117, fita inversaINCA1KIF1C: 4 997 629–5 028 401, fita diretaKIF1CDiagrama de SPNS2: 13 exões na cadeia direta do cromossoma 17Exão 1: 1 local conhecido associado a doençaExão 1: 4 498 881–4 499 417, 537 basesExão 2: 4 513 247–4 513 312, 66 basesExão 3: 4 525 057–4 525 193, 137 basesExão 4: 4 530 632–4 530 783, 152 basesExão 5: 4 531 053–4 531 119, 67 basesExão 6: 4 532 542–4 532 684, 143 basesExão 7: 4 532 977–4 533 129, 153 basesExão 8: 4 533 243–4 533 432, 190 basesExão 9: 4 533 788–4 533 853, 66 basesExão 10: 4 536 076–4 536 174, 99 basesExão 11: 4 536 263–4 536 426, 164 basesExão 12: 4 536 900–4 536 946, 47 basesExão 13: 4 537 453–4 539 035, 1583 bases1510135′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 3,4 kb dos 40,2 kb do gene; 1650 dessas bases codificam a proteína.

Como um teste de genoma lê SPNS2

1

posição em SPNS2 onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica

Nenhuma delas se situa numa região onde as leituras curtas têm dificuldade.

Um genoma completo abrange todos os 40,2 kb de SPNS2, incluindo os intrões, e não apenas os 3,4 kb de exões.

De onde vem esta informação

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos associados a doenças e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
  • Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
  • Versão dos dados 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene SPNS2: SPNS lysolipid transporter 2, sphingosine-1-phosphate. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/spns2

Vancouver

Dante Labs. Gene SPNS2: SPNS lysolipid transporter 2, sphingosine-1-phosphate [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/spns2

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