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Gène

SPNS2

SPNS lysolipid transporter 2, sphingosine-1-phosphate

Résumé

Localisation cytogénétique
17p13.2
Coordonnées
Chromosome 17 : 4 498 881–4 539 035 (GRCh38)
Exons
13 exons sur 40,2 kb
Protéine
549 acides aminés
Aussi appelé
SLC63A2
Transcrit MANE Select
ENST00000329078.8NM_001124758.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SPNS2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SPNS2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de SPNS2. SPNS2 et 32 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 4 018 958 à 5 018 957.Chromosome 1717p13.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.34,2 Mb4,4 Mb4,6 Mb4,8 Mb5 MbZZEF1 : 4 004 432–4 143 628, brin inverseZZEF1CYB5D2 : 4 143 168–4 188 683, brin directCYB5D2ANKFY1 : 4 163 821–4 263 995, brin inverseANKFY1UBE2G1 : 4 269 221–4 366 678, brin inverseUBE2G1SPNS3 : 4 433 940–4 488 208, brin directSPNS3SPNS2 : 4 498 881–4 539 035, brin directSPNS2MYBBP1A : 4 538 897–4 555 403, brin inverseMYBBP1AGGT6 : 4 556 342–4 560 818, brin inverseGGT6SMTNL2 : 4 583 999–4 608 798, brin directSMTNL2ALOX15 : 4 629 736–4 642 294, brin inverseALOX15PELP1 : 4 669 774–4 704 337, brin inversePELP1ARRB2 : 4 710 393–4 721 500, brin directARRB2MED11 : 4 731 411–4 733 610, brin directMED11CXCL16 : 4 732 915–4 740 064, brin inverseCXCL16ZMYND15 : 4 739 108–4 746 119, brin directTM4SF5 : 4 771 835–4 783 220, brin directTM4SF5VMO1 : 4 785 281–4 790 406, brin inverseVMO1GLTPD2 : 4 788 927–4 790 734, brin directGLTPD2PSMB6 : 4 796 144–4 798 503, brin directPSMB6C17orf114 : 4 801 159–4 807 013, brin inversePLD2 : 4 807 074–4 823 434, brin directMINK1 : 4 833 147–4 898 065, brin directMINK1CHRNE : 4 897 769–4 934 438, brin inverseCHRNEC17orf107 : 4 899 418–4 902 934, brin directC17orf107GP1BA : 4 932 261–4 935 023, brin directGP1BASLC25A11 : 4 934 570–4 940 156, brin inverseSLC25A11RNF167 : 4 939 997–4 945 223, brin directPFN1 : 4 945 652–4 950 517, brin inverseENO3 : 4 948 034–4 957 132, brin directSPAG7 : 4 959 226–4 967 835, brin inverseCAMTA2 : 4 967 992–4 987 684, brin inverseINCA1 : 4 988 130–4 999 117, brin inverseINCA1KIF1C : 4 997 629–5 028 401, brin directKIF1CSchéma de SPNS2 : 13 exons sur le brin direct du chromosome 17Exon 1 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 4 498 881–4 499 417, 537 basesExon 2 : 4 513 247–4 513 312, 66 basesExon 3 : 4 525 057–4 525 193, 137 basesExon 4 : 4 530 632–4 530 783, 152 basesExon 5 : 4 531 053–4 531 119, 67 basesExon 6 : 4 532 542–4 532 684, 143 basesExon 7 : 4 532 977–4 533 129, 153 basesExon 8 : 4 533 243–4 533 432, 190 basesExon 9 : 4 533 788–4 533 853, 66 basesExon 10 : 4 536 076–4 536 174, 99 basesExon 11 : 4 536 263–4 536 426, 164 basesExon 12 : 4 536 900–4 536 946, 47 basesExon 13 : 4 537 453–4 539 035, 1 583 bases1510135′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,4 kb sur les 40,2 kb du gène ; 1 650 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit SPNS2

1

position dans SPNS2 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 40,2 kb de SPNS2, introns compris, et pas seulement les 3,4 kb d'exons.

Traits associés à SPNS2

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SPNS2 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SPNS2 : SPNS lysolipid transporter 2, sphingosine-1-phosphate. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/spns2

Vancouver

Dante Labs. Gène SPNS2 : SPNS lysolipid transporter 2, sphingosine-1-phosphate [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/spns2

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