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Gene

PTPRF

protein tyrosine phosphatase receptor type F

Resumo

Localização citogenética
1p34.2
Coordenadas
Cromossoma 1: 43 530 883–43 623 666 (GRCh38)
Exões
34 exões ao longo de 92,8 kb
Proteína
1907 aminoácidos
Símbolos anteriores
LAR
Transcrito MANE Select
ENST00000359947.9NM_002840.5
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Genoma de referênciaGRCh38

As posições nas páginas de genes e variantes seguem esta escolha, neste navegador.

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa PTPRF ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como PTPRF está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Locais conhecidos associados a doença
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 1, com um parêntese onde se situa PTPRF. PTPRF e 22 genes próximos no cromossoma 1, de 43 077 275 a 44 077 274.Cromossoma 11p34.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4443,2 Mb43,4 Mb43,6 Mb43,8 Mb44 MbCFAP144: 43 145 153–43 156 396, fita diretaCFAP144EBNA1BP2: 43 162 085–43 270 936, fita inversaEBNA1BP2CFAP57: 43 172 326–43 254 358, fita diretaCFAP57TMEM125: 43 269 976–43 274 007, fita diretaTMEM125C1orf210: 43 281 271–43 285 908, fita inversaC1orf210TIE1: 43 300 958–43 325 215, fita diretaTIE1MPL: 43 337 808–43 354 466, fita diretaMPLCDC20: 43 358 907–43 363 212, fita diretaCDC20ELOVL1: 43 363 141–43 368 075, fita inversaELOVL1MED8: 43 383 906–43 389 823, fita inversaMED8SZT2: 43 389 882–43 454 247, fita diretaSZT2HYI: 43 450 597–43 453 999, fita inversaHYIPTPRF: 43 530 883–43 623 666, fita diretaPTPRFKDM4A: 43 649 256–43 705 518, fita diretaKDM4A: 43 650 149–43 931 014, fita diretaST3GAL3: 43 705 824–43 931 167, fita diretaST3GAL3ARTN: 43 933 272–43 937 244, fita diretaARTNIPO13: 43 946 672–43 968 024, fita diretaIPO13DPH2: 43 969 975–43 973 373, fita diretaDPH2ATP6V0B: 43 974 487–43 978 299, fita diretaATP6V0BB4GALT2: 43 978 943–43 991 173, fita diretaSLC6A9: 43 989 353–44 031 767, fita inversaCCDC24: 43 991 352–43 996 529, fita diretaDiagrama de PTPRF: 34 exões na cadeia direta do cromossoma 1Exão 9: 1 local conhecido associado a doençaExão 1: 43 530 883–43 531 090, 208 basesExão 2: 43 538 198–43 538 277, 80 basesExão 3: 43 545 031–43 545 166, 136 basesExão 4: 43 553 492–43 553 637, 146 basesExão 5: 43 553 800–43 553 941, 142 basesExão 6: 43 569 590–43 569 778, 189 basesExão 7: 43 578 810–43 578 920, 111 basesExão 8: 43 588 731–43 589 000, 270 basesExão 9: 43 590 972–43 591 553, 582 basesExão 10: 43 591 812–43 591 948, 137 basesExão 11: 43 592 457–43 592 601, 145 basesExão 12: 43 597 748–43 598 053, 306 basesExão 13: 43 598 720–43 598 913, 194 basesExão 14: 43 602 071–43 602 097, 27 basesExão 15: 43 603 416–43 603 533, 118 basesExão 16: 43 603 611–43 604 189, 579 basesExão 17: 43 604 903–43 605 000, 98 basesExão 18: 43 605 190–43 605 443, 254 basesExão 19: 43 605 529–43 605 622, 94 basesExão 20: 43 606 240–43 606 458, 219 basesExão 21: 43 606 814–43 606 968, 155 basesExão 22: 43 609 383–43 609 498, 116 basesExão 23: 43 613 618–43 613 715, 98 basesExão 24: 43 617 445–43 617 568, 124 basesExão 25: 43 617 736–43 617 911, 176 basesExão 26: 43 618 630–43 618 749, 120 basesExão 27: 43 619 048–43 619 202, 155 basesExão 28: 43 619 288–43 619 573, 286 basesExão 29: 43 619 680–43 619 858, 179 basesExão 30: 43 620 095–43 620 221, 127 basesExão 31: 43 620 454–43 620 579, 126 basesExão 32: 43 620 838–43 620 992, 155 basesExão 33: 43 621 097–43 621 232, 136 basesExão 34: 43 621 935–43 623 666, 1732 bases151015202530345′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 7,7 kb dos 92,8 kb do gene; 5724 dessas bases codificam a proteína.

Como um teste de genoma lê PTPRF

1

posição em PTPRF onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica

Nenhuma delas se situa numa região onde as leituras curtas têm dificuldade.

Um genoma completo abrange todos os 92,8 kb de PTPRF, incluindo os intrões, e não apenas os 7,7 kb de exões.

De onde vem esta informação

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos associados a doenças e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
  • Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
  • Versão dos dados 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene PTPRF: protein tyrosine phosphatase receptor type F. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/ptprf

Vancouver

Dante Labs. Gene PTPRF: protein tyrosine phosphatase receptor type F [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/ptprf

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