Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

PTPRF

protein tyrosine phosphatase receptor type F

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
1p34.2
Koordinaadid
Kromosoom 1: 43 530 883–43 623 666 (GRCh38)
Eksonid
34 eksonit, ulatus 92,8 kb
Valk
1907 aminohapet
Varasemad tähised
LAR
MANE Select transkript
ENST00000359947.9NM_002840.5
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni PTPRF veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas PTPRF on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 1, millel on sulg kohal, kus asub PTPRF. PTPRF ja sellele lähedal asuvad 22 geeni kromosoomil 1, vahemikus 43 077 275 kuni 44 077 274.Kromosoom 11p34.2p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4443,2 Mb43,4 Mb43,6 Mb43,8 Mb44 MbCFAP144: 43 145 153–43 156 396, otsene ahelCFAP144EBNA1BP2: 43 162 085–43 270 936, pöördne ahelEBNA1BP2CFAP57: 43 172 326–43 254 358, otsene ahelCFAP57TMEM125: 43 269 976–43 274 007, otsene ahelTMEM125C1orf210: 43 281 271–43 285 908, pöördne ahelC1orf210TIE1: 43 300 958–43 325 215, otsene ahelTIE1MPL: 43 337 808–43 354 466, otsene ahelMPLCDC20: 43 358 907–43 363 212, otsene ahelCDC20ELOVL1: 43 363 141–43 368 075, pöördne ahelELOVL1MED8: 43 383 906–43 389 823, pöördne ahelMED8SZT2: 43 389 882–43 454 247, otsene ahelSZT2HYI: 43 450 597–43 453 999, pöördne ahelHYIPTPRF: 43 530 883–43 623 666, otsene ahelPTPRFKDM4A: 43 649 256–43 705 518, otsene ahelKDM4A: 43 650 149–43 931 014, otsene ahelST3GAL3: 43 705 824–43 931 167, otsene ahelST3GAL3ARTN: 43 933 272–43 937 244, otsene ahelARTNIPO13: 43 946 672–43 968 024, otsene ahelIPO13DPH2: 43 969 975–43 973 373, otsene ahelDPH2ATP6V0B: 43 974 487–43 978 299, otsene ahelATP6V0BB4GALT2: 43 978 943–43 991 173, otsene ahelSLC6A9: 43 989 353–44 031 767, pöördne ahelCCDC24: 43 991 352–43 996 529, otsene ahelPTPRF skeem: 34 eksonit kromosoomi 1 otsene ahelalEkson 9: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 43 530 883–43 531 090, 208 alustEkson 2: 43 538 198–43 538 277, 80 alustEkson 3: 43 545 031–43 545 166, 136 alustEkson 4: 43 553 492–43 553 637, 146 alustEkson 5: 43 553 800–43 553 941, 142 alustEkson 6: 43 569 590–43 569 778, 189 alustEkson 7: 43 578 810–43 578 920, 111 alustEkson 8: 43 588 731–43 589 000, 270 alustEkson 9: 43 590 972–43 591 553, 582 alustEkson 10: 43 591 812–43 591 948, 137 alustEkson 11: 43 592 457–43 592 601, 145 alustEkson 12: 43 597 748–43 598 053, 306 alustEkson 13: 43 598 720–43 598 913, 194 alustEkson 14: 43 602 071–43 602 097, 27 alustEkson 15: 43 603 416–43 603 533, 118 alustEkson 16: 43 603 611–43 604 189, 579 alustEkson 17: 43 604 903–43 605 000, 98 alustEkson 18: 43 605 190–43 605 443, 254 alustEkson 19: 43 605 529–43 605 622, 94 alustEkson 20: 43 606 240–43 606 458, 219 alustEkson 21: 43 606 814–43 606 968, 155 alustEkson 22: 43 609 383–43 609 498, 116 alustEkson 23: 43 613 618–43 613 715, 98 alustEkson 24: 43 617 445–43 617 568, 124 alustEkson 25: 43 617 736–43 617 911, 176 alustEkson 26: 43 618 630–43 618 749, 120 alustEkson 27: 43 619 048–43 619 202, 155 alustEkson 28: 43 619 288–43 619 573, 286 alustEkson 29: 43 619 680–43 619 858, 179 alustEkson 30: 43 620 095–43 620 221, 127 alustEkson 31: 43 620 454–43 620 579, 126 alustEkson 32: 43 620 838–43 620 992, 155 alustEkson 33: 43 621 097–43 621 232, 136 alustEkson 34: 43 621 935–43 623 666, 1732 alust151015202530345′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 7,7 kb kogupikkusega 92,8 kb; neist 5724 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse PTPRF

1

koht geenis PTPRF, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni PTPRF 92,8 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (7,7 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). PTPRF geen: protein tyrosine phosphatase receptor type F. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ptprf

Vancouver

Dante Labs. PTPRF geen: protein tyrosine phosphatase receptor type F [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ptprf

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test