Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

GARIN5A

golgi associated RAB2 interactor 5A

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
19q13.33
Współrzędne
Chromosom 19: 50 466 788–50 476 848 (GRCh38)
Eksony
5 eksonów na odcinku 10,1 kb
Białko
247 aminokwasów
Znany również jako
GARIL5
Poprzednie symbole
FAM71E1
Transkrypt MANE Select
ENST00000600100.6NM_001308429.2
Typ locus
Protein-coding
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu GARIN5A. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu GARIN5A

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 19, z nawiasem wskazującym położenie GARIN5A. GARIN5A i 30 genów w pobliżu na chromosomie 19, od 49 971 818 do 50 971 817.Chromosom 1919q13.33p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4350 Mb50,2 Mb50,4 Mb50,6 Mb50,8 MbSIGLEC16: 49 969 600–49 975 819, nić dodatniejSIGLEC16VRK3: 49 974 537–50 025 946, nić ujemnejVRK3ZNF473: 50 025 714–50 053 414, nić dodatniejZNF473IZUMO2: 50 152 537–50 163 281, nić ujemnejIZUMO2MYH14: 50 188 181–50 310 545, nić dodatniejMYH14KCNC3: 50 311 937–50 333 515, nić ujemnejKCNC3NR1H2: 50 329 639–50 383 404, nić dodatniejNR1H2NAPSA: 50 358 472–50 369 342, nić ujemnejNAPSAPOLD1: 50 384 204–50 418 018, nić dodatniejPOLD1: 50 415 799–50 428 409, nić dodatniejSPIB: 50 418 931–50 431 314, nić dodatniejSPIBMYBPC2: 50 432 772–50 466 328, nić dodatniejMYBPC2GARIN5A: 50 466 788–50 476 848, nić ujemnejGARIN5AEMC10: 50 476 400–50 510 789, nić dodatniejEMC10JOSD2: 50 505 995–50 511 376, nić ujemnejJOSD2ASPDH: 50 511 568–50 514 696, nić ujemnejASPDHLRRC4B: 50 516 892–50 568 435, nić ujemnejLRRC4BSYT3: 50 621 307–50 640 040, nić ujemnejSYT3C19orf81: 50 648 792–50 659 310, nić dodatniejC19orf81SHANK1: 50 659 255–50 719 802, nić ujemnejSHANK1CLEC11A: 50 723 283–50 725 719, nić dodatniejCLEC11AGPR32: 50 770 464–50 771 732, nić dodatniejGPR32SMIM47: 50 776 141–50 793 142, nić ujemnejSMIM47ACP4: 50 790 415–50 795 219, nić dodatniejACP4KLK1: 50 819 146–50 823 787, nić ujemnejKLK1KLK15: 50 825 289–50 837 213, nić ujemnejKLK15KLK3: 50 854 915–50 860 767, nić dodatniejKLK3KLK2: 50 861 568–50 880 567, nić dodatniejKLK2KLK4: 50 906 351–50 911 395, nić ujemnejKLK4KLK5: 50 943 249–50 953 314, nić ujemnejKLK5KLK6: 50 958 631–50 969 673, nić ujemnejKLK6Schemat GARIN5A: 5 eksonów na nici ujemnej chromosomu 19Ekson 5: 50 466 788–50 466 955, 168 zasadEkson 4: 50 467 622–50 467 829, 208 zasadEkson 3: 50 475 325–50 475 503, 179 zasadEkson 2: 50 475 833–50 475 933, 101 zasadEkson 1: 50 476 130–50 476 848, 719 zasad543215′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 1,4 kb z 10,1 kb genu; 744 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie GARIN5A

1

pozycja w genie GARIN5A, w której ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną

Żadne z nich nie przypada na region, w którym krótkie odczyty mają trudności.

Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 10,1 kb genu GARIN5A, łącznie z intronami, a nie tylko 1,4 kb eksonów.

Linki zewnętrzne

Skąd pochodzą te dane

  • HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
  • Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen GARIN5A: golgi associated RAB2 interactor 5A. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/garin5a

Vancouver

Dante Labs. Gen GARIN5A: golgi associated RAB2 interactor 5A [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/garin5a

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test