Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel

Gen

GARIN5A

golgi associated RAB2 interactor 5A

Sammanfattning

Cytogenetisk position
19q13.33
Koordinater
Kromosom 19: 50 466 788–50 476 848 (GRCh38)
Exoner
5 exoner på 10,1 kb
Protein
247 aminosyror
Även känd som
GARIL5
Tidigare symboler
FAM71E1
MANE Select-transkript
ENST00000600100.6NM_001308429.2
Lokustyp
gene with protein product
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

ReferensgenomGRCh38

Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser GARIN5A ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är GARIN5A uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 19, med en parentes där GARIN5A finns. GARIN5A och 30 gener i närheten på kromosom 19, från 49 971 818 till 50 971 817.Kromosom 1919q13.33p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4350 Mb50,2 Mb50,4 Mb50,6 Mb50,8 MbSIGLEC16: 49 969 600–49 975 819, framåt-strängSIGLEC16VRK3: 49 974 537–50 025 946, bakåt-strängVRK3ZNF473: 50 025 714–50 053 414, framåt-strängZNF473IZUMO2: 50 152 537–50 163 281, bakåt-strängIZUMO2MYH14: 50 188 181–50 310 545, framåt-strängMYH14KCNC3: 50 311 937–50 333 515, bakåt-strängKCNC3NR1H2: 50 329 639–50 383 404, framåt-strängNR1H2NAPSA: 50 358 472–50 369 342, bakåt-strängNAPSAPOLD1: 50 384 204–50 418 018, framåt-strängPOLD1: 50 415 799–50 428 409, framåt-strängSPIB: 50 418 931–50 431 314, framåt-strängSPIBMYBPC2: 50 432 772–50 466 328, framåt-strängMYBPC2GARIN5A: 50 466 788–50 476 848, bakåt-strängGARIN5AEMC10: 50 476 400–50 510 789, framåt-strängEMC10JOSD2: 50 505 995–50 511 376, bakåt-strängJOSD2ASPDH: 50 511 568–50 514 696, bakåt-strängASPDHLRRC4B: 50 516 892–50 568 435, bakåt-strängLRRC4BSYT3: 50 621 307–50 640 040, bakåt-strängSYT3C19orf81: 50 648 792–50 659 310, framåt-strängC19orf81SHANK1: 50 659 255–50 719 802, bakåt-strängSHANK1CLEC11A: 50 723 283–50 725 719, framåt-strängCLEC11AGPR32: 50 770 464–50 771 732, framåt-strängGPR32SMIM47: 50 776 141–50 793 142, bakåt-strängSMIM47ACP4: 50 790 415–50 795 219, framåt-strängACP4KLK1: 50 819 146–50 823 787, bakåt-strängKLK1KLK15: 50 825 289–50 837 213, bakåt-strängKLK15KLK3: 50 854 915–50 860 767, framåt-strängKLK3KLK2: 50 861 568–50 880 567, framåt-strängKLK2KLK4: 50 906 351–50 911 395, bakåt-strängKLK4KLK5: 50 943 249–50 953 314, bakåt-strängKLK5KLK6: 50 958 631–50 969 673, bakåt-strängKLK6Diagram över GARIN5A: 5 exoner på bakåt-strängen av kromosom 19Exon 5: 50 466 788–50 466 955, 168 baserExon 4: 50 467 622–50 467 829, 208 baserExon 3: 50 475 325–50 475 503, 179 baserExon 2: 50 475 833–50 475 933, 101 baserExon 1: 50 476 130–50 476 848, 719 baser543215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 1,4 kb av genens 10,1 kb, och 744 av dessa baser kodar för proteinet.

Så läser ett genomtest GARIN5A

1

position i GARIN5A där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.

En helgenomsanalys täcker alla 10,1 kb av GARIN5A, med introner inräknade, inte bara de 1,4 kb exoner.

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). GARIN5A-genen: golgi associated RAB2 interactor 5A. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/garin5a

Vancouver

Dante Labs. GARIN5A-genen: golgi associated RAB2 interactor 5A [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/garin5a

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test