Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

GARIN5A

golgi associated RAB2 interactor 5A

Shrnutí

Cytogenetická poloha
19q13.33
Souřadnice
Chromozom 19: 50 466 788–50 476 848 (GRCh38)
Exony
5 exonů na 10,1 kb
Protein
247 aminokyselin
Další názvy
GARIL5
Předchozí symboly
FAM71E1
Transkript MANE Select
ENST00000600100.6NM_001308429.2
Typ lokusu
gene with protein product
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen GARIN5A. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je GARIN5A uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 19, se závorkou u GARIN5A. GARIN5A a 30 genů poblíž na chromozomu 19, od 49 971 818 do 50 971 817.Chromozom 1919q13.33p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4350 Mb50,2 Mb50,4 Mb50,6 Mb50,8 MbSIGLEC16: 49 969 600–49 975 819, řetězec dopřednémSIGLEC16VRK3: 49 974 537–50 025 946, řetězec zpětnémVRK3ZNF473: 50 025 714–50 053 414, řetězec dopřednémZNF473IZUMO2: 50 152 537–50 163 281, řetězec zpětnémIZUMO2MYH14: 50 188 181–50 310 545, řetězec dopřednémMYH14KCNC3: 50 311 937–50 333 515, řetězec zpětnémKCNC3NR1H2: 50 329 639–50 383 404, řetězec dopřednémNR1H2NAPSA: 50 358 472–50 369 342, řetězec zpětnémNAPSAPOLD1: 50 384 204–50 418 018, řetězec dopřednémPOLD1: 50 415 799–50 428 409, řetězec dopřednémSPIB: 50 418 931–50 431 314, řetězec dopřednémSPIBMYBPC2: 50 432 772–50 466 328, řetězec dopřednémMYBPC2GARIN5A: 50 466 788–50 476 848, řetězec zpětnémGARIN5AEMC10: 50 476 400–50 510 789, řetězec dopřednémEMC10JOSD2: 50 505 995–50 511 376, řetězec zpětnémJOSD2ASPDH: 50 511 568–50 514 696, řetězec zpětnémASPDHLRRC4B: 50 516 892–50 568 435, řetězec zpětnémLRRC4BSYT3: 50 621 307–50 640 040, řetězec zpětnémSYT3C19orf81: 50 648 792–50 659 310, řetězec dopřednémC19orf81SHANK1: 50 659 255–50 719 802, řetězec zpětnémSHANK1CLEC11A: 50 723 283–50 725 719, řetězec dopřednémCLEC11AGPR32: 50 770 464–50 771 732, řetězec dopřednémGPR32SMIM47: 50 776 141–50 793 142, řetězec zpětnémSMIM47ACP4: 50 790 415–50 795 219, řetězec dopřednémACP4KLK1: 50 819 146–50 823 787, řetězec zpětnémKLK1KLK15: 50 825 289–50 837 213, řetězec zpětnémKLK15KLK3: 50 854 915–50 860 767, řetězec dopřednémKLK3KLK2: 50 861 568–50 880 567, řetězec dopřednémKLK2KLK4: 50 906 351–50 911 395, řetězec zpětnémKLK4KLK5: 50 943 249–50 953 314, řetězec zpětnémKLK5KLK6: 50 958 631–50 969 673, řetězec zpětnémKLK6Schéma GARIN5A: 5 exonů na zpětném řetězci chromozomu 19Exon 5: 50 466 788–50 466 955, 168 bázíExon 4: 50 467 622–50 467 829, 208 bázíExon 3: 50 475 325–50 475 503, 179 bázíExon 2: 50 475 833–50 475 933, 101 bázíExon 1: 50 476 130–50 476 848, 719 bází543215′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 1,4 kb z 10,1 kb genu; 744 těchto bází kódují protein.

Jak genetický test čte GARIN5A

1

pozice v genu GARIN5A, kterou ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní

Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.

Celý genom pokrývá všech 10,1 kb genu GARIN5A, včetně intronů, nikoli jen 1,4 kb exonů.

Externí odkazy

Odkud údaje pocházejí

  • HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
  • Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen GARIN5A: golgi associated RAB2 interactor 5A. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/garin5a

Vancouver

Dante Labs. Gen GARIN5A: golgi associated RAB2 interactor 5A [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/garin5a

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test