Gen
PAM16
presequence translocase associated motor 16
- HGNC 29679↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000217930↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 51025↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 16p13.3
- Koordinater
- Kromosom 16: 4 340 251–4 351 321 (GRCh38)
- Eksoner
- 5 eksoner over 11,1 kb
- Protein
- 125 aminosyrer
- Også kjent som
- Magmas, Tim16, TIMM16
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000318059.8NM_016069.11
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pam16.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes PAM16 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ingen Genome Test-rapport leser PAM16 ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.
Slik er PAM16 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 0,5 kb av genets 11,1 kb, og 378 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av PAM16
2Lav
Hvor vanskelig PAM16 er å sekvensere med korte leser, av 100Hver stolpe er andelen av PAM16s eksonbaser i den typen vanskelige regioner. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver enkelt koster for et kortlest-kall: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.0 %
- GC-innholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.17 %
- ReferansedekningHull i referansesammenstillingen i nærheten, der det ikke finnes noen sekvens som leser kan justeres mot. Vekt 10 %.0 %
Egenskaper knyttet til PAM16
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene PAM16 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). PAM16-genet: presequence translocase associated motor 16. Hentet 18. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/pam16
Dante Labs. PAM16-genet: presequence translocase associated motor 16 [Internett]. [sitert 18. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/pam16
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker