Gen
RALGAPA1
Ral GTPase activating protein catalytic subunit alpha 1
- HGNC 17770↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000174373↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 253959↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 14q13.2
- Coördinaten
- Chromosoom 14: 35.538.356–35.809.295 (GRCh38)
- Exons
- 42 exons over 270,9 kb
- Eiwit
- 2.542 aminozuren
- Ook bekend als
- GRIPE, DKFZp667F074, KIAA0884, Tulip1, RalGAPalpha1
- Eerdere symbolen
- GARNL1
- MANE Select-transcript
- ENST00000680220.1NM_001346249.2
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ralgapa1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees RALGAPA1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Geen enkel Genome Test-rapport leest RALGAPA1 nog. De test leest uw volledige genoom uit, dus uw gegevens bevatten het toch.
Opbouw van RALGAPA1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 9,4 kb van de 270,9 kb van het gen; 7.629 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van RALGAPA1
19Gemiddeld
Hoe moeilijk RALGAPA1 met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100Elke balk is het aandeel van de exonbasen van RALGAPA1 in dat type moeilijke regio. De score weegt deze naar hoeveel elk een short-read-call kost: 0 wanneer geen enkele base in een van deze regio's valt, 100 wanneer elke base in alle regio's valt.
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek geplaatst kunnen worden, waardoor een call daar kan ontbreken of onjuist kan zijn. Gewicht 35%.39%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.14%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen schuiven en die ze mogelijk niet overbruggen. Gewicht 15%.3,4%
- GC-gehalteVensters onder 25% of boven 65% G en C, die de bibliotheekvoorbereiding slechts dun dekt. Gewicht 10%.11%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentieassemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Gewicht 10%.0%
6
posities in RALGAPA1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
4 ervan (67%) vallen in gebieden die korte reads lastig vinden.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (4 posities)
Een volledig genoom dekt alle 270,9 kb van RALGAPA1, inclusief intronen, en niet alleen de 9,4 kb aan exonen.
Kenmerken gekoppeld aan RALGAPA1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die RALGAPA1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of head or neck
- Gum enlargement
- Nasal tip, upturned
- Thick eyebrow
- Broad head shape
- Depressed nasal bridge
- Flat back of skull
- High frontal hairline
- Horizontal eyebrow
Toon 3 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). RALGAPA1-gen: Ral GTPase activating protein catalytic subunit alpha 1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/ralgapa1
Dante Labs. RALGAPA1-gen: Ral GTPase activating protein catalytic subunit alpha 1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/ralgapa1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken