Pereiti prie turinio
Naudokite savo HSA ar FSA lėšas

Genas

OCLN

occludin

Santrauka

Citogenetinė vieta
5q13.2
Koordinatės
Chromosoma 5: 69 492 790–69 558 104 (GRCh38)
Eksonai
9 eksonų per 65,3 kb
Baltymas
522 aminorūgščių
Taip pat žinomas kaip
PPP1R115
MANE Select transkriptas
ENST00000396442.7NM_001205254.2
Lokuso tipas
gene with protein product
  • Labai aukštas
  • Patikimas
  • Žemas
  • Labai žemas

Atskaitos genomasGRCh38

Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.

Kuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu

Nė viena Genome Test ataskaita dar nenuskaito OCLN geno. Testas seka visą jūsų genomą, todėl jūsų duomenyse jis vis tiek yra.

Kaip išdėstytas OCLN

  • Koduojanti seka
  • Netransliuojama sritis
  • Intronas
  • Transkripcijos kryptis
  • Žinomos su liga susijusios vietos
  • Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Chromosoma 5, su skliaustu, kur yra OCLN. OCLN ir dar 14 genų šalia jo chromosomoje 5, nuo 69 025 447 iki 70 025 446.Chromosoma 55q13.2p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.369,2 Mb69,4 Mb69,6 Mb69,8 Mb70 MbSLC30A5: 69 093 917–69 156 940, tiesioginė grandinėSLC30A5CCNB1: 69 167 004–69 178 389, tiesioginė grandinėCCNB1CENPH: 69 189 537–69 210 357, tiesioginė grandinėCENPHKGD4: 69 217 712–69 231 410, tiesioginė grandinėKGD4CDK7: 69 234 550–69 277 495, tiesioginė grandinėCDK7CCDC125: 69 279 859–69 332 828, atvirkštinė grandinėCCDC125AK6: 69 333 643–69 370 026, atvirkštinė grandinėAK6TAF9: 69 362 026–69 370 026, atvirkštinė grandinėTAF9RAD17: 69 369 293–69 414 806, tiesioginė grandinėRAD17MARVELD2: 69 415 065–69 444 330, tiesioginė grandinėMARVELD2OCLN: 69 492 790–69 558 104, tiesioginė grandinėOCLNGTF2H2C: 69 558 392–69 595 221, tiesioginė grandinėGTF2H2C: 69 632 080–69 636 399, tiesioginė grandinė: 69 898 769–69 903 085, atvirkštinė grandinėSERF1B: 70 025 241–70 043 113, tiesioginė grandinėSERF1BOCLN diagrama: 9 eksonų, chromosoma 5, tiesioginė grandisEkson 3: 4 žinomų su liga susijusių vietųEkson 5: 1 žinoma su liga susijusi vietaEkson 7: 1 žinoma su liga susijusi vietaEkson 9: 1 žinoma su liga susijusi vietaEksonas 1: 69 492 790–69 492 900, 111 baziųEksonas 2: 69 504 177–69 504 294, 118 baziųEksonas 3: 69 509 141–69 509 819, 679 baziųEksonas 4: 69 513 948–69 514 109, 162 baziųEksonas 5: 69 534 694–69 534 839, 146 baziųEksonas 6: 69 544 904–69 545 119, 216 baziųEksonas 7: 69 547 930–69 548 101, 172 baziųEksonas 8: 69 551 544–69 551 585, 42 baziųEksonas 9: 69 553 570–69 558 104, 4 535 bazių1234567895′3′

Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.

Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).

Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.

Eksonai sudaro 6,2 kb iš 65,3 kb geno; 1 569 šių bazių koduoja baltymą.

Kaip genomo tyrimas nuskaito OCLN

11

OCLN geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį

Iš jų 6 (55 %) patenka į sritis, kurias trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.

  • Low mappability (6 vietų)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (6 vietų)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Viso genomo sekvenavimas apima visus 65,3 kb OCLN geno, įskaitant intronus, o ne tik 6,2 kb eksonų.

Iš kur tai

  • HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
  • MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
  • ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
  • Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
  • Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.

Cituoti šį puslapį

APA

Dante Labs. (be datos). OCLN genas: occludin. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/ocln

Vancouver

Dante Labs. OCLN genas: occludin [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/ocln

Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.

Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites

Įsigyti savo Genome Test