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Gene

VPS51

VPS51 subunit of GARP complex

Sintesi

Localizzazione citogenetica
11q13.1
Coordinate
Cromosoma 11: 65.096.214–65.111.862 (GRCh38)
Esoni
10 esoni su 15,6 kb
Proteina
782 amminoacidi
Noto anche come
ANG2, ANG3, FFR
Simboli precedenti
C11orf3, C11orf2
Trascritto MANE Select
ENST00000279281.8NM_013265.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora VPS51. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di VPS51

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 11, con una parentesi dove si trova VPS51. VPS51 e 42 geni nelle vicinanze sul cromosoma 11, da 64.604.038 a 65.604.037.Cromosoma 1111q13.1p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2564,8 Mb65 Mb65,2 Mb65,4 Mb65,6 MbNRXN2: 64.606.174–64.723.202, filamento inversoNRXN2RASGRP2: 64.726.905–64.745.456, filamento inversoRASGRP2PYGM: 64.746.389–64.759.990, filamento inversoPYGMSF1: 64.764.605–64.778.802, filamento inversoSF1MAP4K2: 64.784.918–64.803.245, filamento inversoMAP4K2MEN1: 64.803.500–64.811.294, filamento inversoMEN1CDC42BPG: 64.823.051–64.844.735, filamento inversoCDC42BPGEHD1: 64.851.642–64.888.372, filamento inversoEHD1ATG2A: 64.894.531–64.917.249, filamento inversoATG2APPP2R5B: 64.917.553–64.934.480, filamento direttoPPP2R5BGPHA2: 64.934.471–64.935.894, filamento inversoGPHA2MAJIN: 64.937.517–64.972.113, filamento inversoMAJINBATF2: 64.987.945–64.997.018, filamento inversoARL2: 65.013.735–65.024.328, filamento direttoARL2ARL2-SNX15: 65.014.182–65.040.570, filamento direttoSNX15: 65.027.404–65.040.578, filamento direttoSNX15SAC3D1: 65.040.897–65.047.320, filamento direttoSAC3D1NAALADL1: 65.044.818–65.058.558, filamento inversoCDCA5: 65.066.299–65.084.164, filamento inversoZFPL1: 65.084.210–65.088.409, filamento direttoCATSPERH: 65.084.974–65.089.375, filamento inversoCATSPERHVPS51: 65.096.214–65.111.862, filamento direttoVPS51TM7SF2: 65.111.845–65.116.677, filamento direttoTM7SF2ZNHIT2: 65.116.403–65.117.701, filamento inversoZNHIT2FAU: 65.120.182–65.122.221, filamento inversoSYVN1: 65.121.780–65.146.912, filamento inversoMRPL49: 65.122.183–65.127.371, filamento direttoSPDYC: 65.166.137–65.173.380, filamento direttoSPDYCCAPN1: 65.180.566–65.212.006, filamento direttoCAPN1POLA2: 65.261.835–65.305.959, filamento direttoPOLA2: 65.261.928–65.326.543, filamento direttoCDC42EP2: 65.298.955–65.322.662, filamento direttoCDC42EP2DPF2: 65.333.792–65.354.262, filamento direttoDPF2TIGD3: 65.354.746–65.357.613, filamento direttoTIGD3SLC25A45: 65.375.186–65.384.550, filamento inversoSLC25A45FRMD8: 65.386.592–65.413.526, filamento direttoFRMD8SCYL1: 65.525.044–65.538.711, filamento direttoSCYL1LTBP3: 65.538.556–65.558.930, filamento inversoLTBP3ZNRD2: 65.570.459–65.574.203, filamento direttoZNRD2FAM89B: 65.572.349–65.574.199, filamento direttoFAM89BEHBP1L1: 65.575.943–65.594.089, filamento direttoKCNK7: 65.592.836–65.595.996, filamento inversoMAP3K11: 65.597.149–65.615.382, filamento inversoDiagramma di VPS51: 10 esoni sul filamento diretto del cromosoma 11Esone 3: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 6: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 1: 65.096.214–65.096.478, 265 basiEsone 2: 65.096.998–65.097.127, 130 basiEsone 3: 65.107.581–65.107.727, 147 basiEsone 4: 65.107.803–65.108.022, 220 basiEsone 5: 65.108.197–65.108.914, 718 basiEsone 6: 65.109.280–65.109.495, 216 basiEsone 7: 65.109.705–65.109.923, 219 basiEsone 8: 65.110.482–65.110.603, 122 basiEsone 9: 65.110.694–65.110.781, 88 basiEsone 10: 65.111.327–65.111.862, 536 basi12468105′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,7 kb dei 15,6 kb del gene; 2349 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge VPS51

2

posizioni in VPS51 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 15,6 kb di VPS51, introni inclusi, non solo i 2,7 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene VPS51: VPS51 subunit of GARP complex. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/vps51

Vancouver

Dante Labs. Gene VPS51: VPS51 subunit of GARP complex [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/vps51

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