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Gene

GPC6

glypican 6

Sintesi

Localizzazione citogenetica
13q31.3-q32.1
Coordinate
Cromosoma 13: 93.226.807–94.408.020 (GRCh38)
Esoni
9 esoni su 1181,2 kb
Proteina
555 amminoacidi
Trascritto MANE Select
ENST00000377047.9NM_005708.5
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora GPC6. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di GPC6

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 13, con una parentesi dove si trova GPC6. GPC6 e 8 geni nelle vicinanze sul cromosoma 13, da 92.045.593 a 95.589.234.Cromosoma 1313q31.3-q32.1p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3492,5 Mb93 Mb93,5 Mb94 Mb94,5 Mb95 Mb95,5 MbGPC5: 91.398.585–92.873.682, filamento direttoGPC5GPC6: 93.226.807–94.408.020, filamento direttoGPC6DCT: 94.436.811–94.479.682, filamento inversoDCTTGDS: 94.574.041–94.596.286, filamento inversoTGDSGPR180: 94.601.788–94.653.091, filamento direttoGPR180SOX21: 94.709.622–94.712.545, filamento inversoSOX21ABCC4: 95.019.831–95.301.822, filamento inversoABCC4CLDN10: 95.433.594–95.603.306, filamento direttoCLDN10DZIP1: 95.578.202–95.644.740, filamento inversoDZIP1Diagramma di GPC6: 9 esoni sul filamento diretto del cromosoma 13Esone 3: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 1: 93.226.807–93.227.616, 810 basiEsone 2: 93.545.263–93.545.421, 159 basiEsone 3: 93.830.154–93.830.545, 392 basiEsone 4: 94.027.729–94.027.894, 166 basiEsone 5: 94.286.349–94.286.479, 131 basiEsone 6: 94.305.980–94.306.123, 144 basiEsone 7: 94.382.414–94.382.550, 137 basiEsone 8: 94.398.466–94.398.641, 176 basiEsone 9: 94.403.015–94.408.020, 5006 basi1595′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 7,1 kb dei 1181,2 kb del gene; 1668 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge GPC6

1

posizione in GPC6 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 1181,2 kb di GPC6, introni inclusi, non solo i 7,1 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene GPC6: glypican 6. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/gpc6

Vancouver

Dante Labs. Gene GPC6: glypican 6 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/gpc6

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