Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

GPC6

glypican 6

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
13q31.3-q32.1
Koordinaadid
Kromosoom 13: 93 226 807–94 408 020 (GRCh38)
Eksonid
9 eksonit, ulatus 1181,2 kb
Valk
555 aminohapet
MANE Select transkript
ENST00000377047.9NM_005708.5
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni GPC6 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas GPC6 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 13, millel on sulg kohal, kus asub GPC6. GPC6 ja sellele lähedal asuvad 8 geeni kromosoomil 13, vahemikus 92 045 593 kuni 95 589 234.Kromosoom 1313q31.3-q32.1p13p12p11.2p11.1q11q12.11q12.12q12.13q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.11q14.12q14.13q14.2q14.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q3492,5 Mb93 Mb93,5 Mb94 Mb94,5 Mb95 Mb95,5 MbGPC5: 91 398 585–92 873 682, otsene ahelGPC5GPC6: 93 226 807–94 408 020, otsene ahelGPC6DCT: 94 436 811–94 479 682, pöördne ahelDCTTGDS: 94 574 041–94 596 286, pöördne ahelTGDSGPR180: 94 601 788–94 653 091, otsene ahelGPR180SOX21: 94 709 622–94 712 545, pöördne ahelSOX21ABCC4: 95 019 831–95 301 822, pöördne ahelABCC4CLDN10: 95 433 594–95 603 306, otsene ahelCLDN10DZIP1: 95 578 202–95 644 740, pöördne ahelDZIP1GPC6 skeem: 9 eksonit kromosoomi 13 otsene ahelalEkson 3: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 93 226 807–93 227 616, 810 alustEkson 2: 93 545 263–93 545 421, 159 alustEkson 3: 93 830 154–93 830 545, 392 alustEkson 4: 94 027 729–94 027 894, 166 alustEkson 5: 94 286 349–94 286 479, 131 alustEkson 6: 94 305 980–94 306 123, 144 alustEkson 7: 94 382 414–94 382 550, 137 alustEkson 8: 94 398 466–94 398 641, 176 alustEkson 9: 94 403 015–94 408 020, 5006 alust1595′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 7,1 kb kogupikkusega 1181,2 kb; neist 1668 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse GPC6

1

koht geenis GPC6, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni GPC6 1181,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (7,1 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). GPC6 geen: glypican 6. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/gpc6

Vancouver

Dante Labs. GPC6 geen: glypican 6 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/gpc6

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test