Gene
EGLN1
egl-9 family hypoxia inducible factor 1
- HGNC 1232↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000135766↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 54583↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 1q42.2
- Coordinate
- Cromosoma 1: 231.363.756–231.422.287 (GRCh38)
- Esoni
- 5 esoni su 58,5 kb
- Proteina
- 426 amminoacidi
- Noto anche come
- SM-20, PHD2, ZMYND6, HIFPH2
- Simboli precedenti
- C1orf12
- Trascritto MANE Select
- ENST00000366641.4NM_022051.3
- Tipo di locus
- Protein-coding
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
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Feocromocitoma e paraganglioma ereditari
- Eritrocitosi correlata a EGLN1 e predisposizione a feocromocitoma/paragangliomaAutosomica dominante
Varianti in EGLN1 che causano un aumento del numero di globuli rossi e un maggiore rischio di feocromocitoma e paraganglioma.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 1 submitter GenCC lo valuta come definitivo o forte
Policitemia
- Eritrocitosi familiare 3 (EGLN1)Autosomica dominante
Una forma dominante di eritrocitosi ereditaria causata da variazioni in EGLN1 che alterano il meccanismo con cui l'organismo rileva i livelli di ossigeno e aumentano la produzione di globuli rossi.
- 4 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
Conoscere la causa ereditaria evita che la condizione venga confusa con la policitemia vera o con altre cause acquisite e permette di risparmiare indagini non necessarie.
Struttura di EGLN1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 4,3 kb dei 58,5 kb del gene; 1281 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di EGLN1
14
posizioni in EGLN1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di queste ricade in una regione che le letture corte faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 58,5 kb di EGLN1, introni compresi, non solo i 4,3 kb di esoni.
Tratti collegati a EGLN1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che EGLN1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-17: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.17-8666dff2.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene EGLN1: egl-9 family hypoxia inducible factor 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/egln1
Dante Labs. Gene EGLN1: egl-9 family hypoxia inducible factor 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/egln1
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