Gén
SFRP4
secreted frizzled related protein 4
- HGNC 10778↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000106483↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 6424↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 7p14.1
- Koordináták
- 7. kromoszóma: 37 905 932–37 916 817 (GRCh38)
- Exonok
- 6 exon, összesen 10,9 kb
- Fehérje
- 346 aminosav
- Más néven ismert
- frpHE, FRP-4, FRPHE, FRZB-2
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000436072.7NM_003014.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sfrp4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a SFRP4-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Sclerosing Bone Dysplasias (High Bone Mass)
- Pyle diseaseAutoszomális recesszív
A condition caused by SFRP4 variants in which the ends of the long bones are widened and thin-walled, with a tendency to fractures.
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A SFRP4 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 10,9 kb-jából 2,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1041 bázis kódolja a fehérjét.
SFRP4 szekvenálása
3Alacsony
Mennyire nehéz a SFRP4 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-bólMinden oszlop azt mutatja, hogy SFRP4 exonjainak bázisai közül mekkora rész esik az adott típusú nehezen vizsgálható régióba. A pontszám ezeket az egyes régiók rövid olvasatú vizsgálatra gyakorolt hatása szerint súlyozza: 0, ha egyetlen bázis sem esik egyikbe sem, 100, ha minden bázis mindegyikbe beletartozik.
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így ott a hívás hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 35%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 30%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket esetleg nem fednek le. Súly: 15%.6,2%
- GC-tartalom25%-nál kevesebb vagy 65%-nál több G és C bázist tartalmazó ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 10%.16%
- Referencia-lefedettségHiányosságok a közeli referenciaszekvenciában, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez a rövid olvasatokat illeszteni lehetne. Súly: 10%.0%
6
a SFRP4 génben olyan pozíció, ahol a ClinVar a változást patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősíti
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen találnak meg.
A teljes genom a SFRP4 gén mind a 10,9 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az 2,9 kb-nyi exont.
A(z) SFRP4 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) SFRP4 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of head or neck
- Bad bite
- Big lower jaw
- Craniofacial osteosclerosis
- Dental cavities
- Missing paranasal sinuses
- Delayed eruption of permanent teeth
- Delayed eruption of teeth
- Delayed loss of baby teeth
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the musculoskeletal system
- Low solidness and mass of the bones
- Thin bony cortex
- Increased susceptibility to fractures
- Medial widening of clavicle
- Back pain
- Flattened vertebrae
- Muscle weakness
- Scoliosis
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-17 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). SFRP4 gén: secreted frizzled related protein 4. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/sfrp4
Dante Labs. SFRP4 gén: secreted frizzled related protein 4 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/sfrp4
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt