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Gène

TRANK1

tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1

Résumé

Localisation cytogénétique
3p22.2
Coordonnées
Chromosome 3 : 36 826 819–36 945 054 (GRCh38)
Exons
24 exons sur 118,2 kb
Protéine
2 969 acides aminés
Aussi appelé
LBA1, KIAA0342
Transcrit MANE Select
ENST00000645898.2NM_001329998.2
Type de locus
gene with protein product

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TRANK1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TRANK1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de TRANK1. TRANK1 et 6 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 36 385 937 à 37 385 936.Chromosome 33p22.2p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q2936,4 Mb36,6 Mb36,8 Mb37 Mb37,2 MbSTAC : 36 380 321–36 548 045, brin directSTACDCLK3 : 36 712 409–36 764 553, brin inverseDCLK3TRANK1 : 36 826 819–36 945 054, brin inverseTRANK1EPM2AIP1 : 36 985 043–36 993 131, brin inverseEPM2AIP1MLH1 : 36 992 834–37 051 505, brin directMLH1LRRFIP2 : 37 049 134–37 183 689, brin inverseLRRFIP2GOLGA4 : 37 243 184–37 366 879, brin directGOLGA4Schéma de TRANK1 : 24 exons sur le brin inverse du chromosome 3Exon 24 : 36 826 819–36 828 375, 1 557 basesExon 23 : 36 829 564–36 829 662, 99 basesExon 22 : 36 830 873–36 833 919, 3 047 basesExon 21 : 36 834 762–36 834 907, 146 basesExon 20 : 36 838 372–36 838 504, 133 basesExon 19 : 36 838 613–36 838 716, 104 basesExon 18 : 36 842 622–36 842 710, 89 basesExon 17 : 36 846 248–36 846 404, 157 basesExon 16 : 36 847 200–36 847 346, 147 basesExon 15 : 36 851 719–36 851 856, 138 basesExon 14 : 36 852 146–36 852 345, 200 basesExon 13 : 36 855 173–36 858 049, 2 877 basesExon 12 : 36 858 718–36 858 894, 177 basesExon 11 : 36 860 906–36 861 160, 255 basesExon 10 : 36 864 319–36 864 480, 162 basesExon 9 : 36 874 126–36 874 296, 171 basesExon 8 : 36 889 829–36 889 960, 132 basesExon 7 : 36 892 202–36 892 340, 139 basesExon 6 : 36 892 901–36 892 984, 84 basesExon 5 : 36 895 640–36 895 758, 119 basesExon 4 : 36 899 109–36 899 259, 151 basesExon 3 : 36 903 149–36 903 275, 127 basesExon 2 : 36 908 323–36 908 454, 132 basesExon 1 : 36 944 787–36 945 054, 268 bases2422201816141210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 10,6 kb sur les 118,2 kb du gène ; 8 910 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TRANK1 : tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/trank1

Vancouver

Dante Labs. Gène TRANK1 : tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/trank1

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