Geen
CYP2C9
cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9
- HGNC 2623↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000138109↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 1559↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 10q23.33
- Koordinaadid
- Kromosoom 10: 94 938 658–94 990 091 (GRCh38)
- Eksonid
- 9 eksonit, ulatus 51,4 kb
- Valk
- 490 aminohapet
- Tuntud ka kui
- P450IIC9
- Varasemad tähised
- CYP2C10
- MANE Select transkript
- ENST00000260682.8NM_000771.4
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cyp2c9.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe CYP2C9 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestCYP2C9 ja ravimid
Varfariini ja MSPVA-de metabolism
Farmakogenomika
CYP2C9 eemaldab varfariini, fenütoiini ja paljusid MSPVA-sid — sealhulgas tselekoksiibi, ibuprofeeni, meloksikaami ja piroksikaami. Vähenenud funktsiooniga alleelid aeglustavad seda eemaldamist, vähendades vajalikku varfariini annust ning suurendades teiste ravimite ekspositsiooni.
- Kui teile kunagi määratakse varfariin, võib genotüübil põhinev annustamine (CYP2C9 + VKORC1 + CYP4F2) lühendada aega stabiilse annuseni jõudmiseks.
- MSPVA-de, nagu tselekoksiib, ibuprofeen, flurbiprofeen, meloksikaam ja piroksikaam, puhul võivad halvad metaboliseerijad vajada madalamat annust või alternatiivi — eriti pikaajalisel kasutamisel.
- Oluline krambivastaste ravimite fenütoiini ja fosfenütoiini puhul, mille korral vähenenud aktiivsus suurendab toksilisuse riski.
- Siponimod, skleroosi ravim, nõuab enne väljakirjutamist CYP2C9 genotüpiseerimist ning seda ei kasutata inimestel, kellel on kaks *3 koopiat.
Aruande loetavad alleelid
- *3No function
- *6No function
- *5Decreased function
- *11Decreased function
- *1Normal function
- *2Decreased function
- *8Decreased function
Tulemused, mida CPIC kirjeldab
- Poor Metabolizer
- Indeterminate
- Normal Metabolizer
- Intermediate Metabolizer
Ravim CPIC tase Juhend celecoxib A CYP2C9 and NSAIDs flurbiprofen A CYP2C9 and NSAIDs fluvastatin A SLCO1B1, ABCG2, CYP2C9, and Statins fosphenytoin A CYP2C9, HLA-B and Phenytoin ibuprofen A CYP2C9 and NSAIDs lornoxicam A CYP2C9 and NSAIDs meloxicam A CYP2C9 and NSAIDs phenytoin A CYP2C9, HLA-B and Phenytoin piroxicam A CYP2C9 and NSAIDs siponimod A tenoxicam A CYP2C9 and NSAIDs warfarin A CYP2C9, VKORC1, CYP4F2 and Warfarin acenocoumarol B Näita veel 12 ravimit
Ravim CPIC tase Juhend avatrombopag B/C dronabinol B/C erdafitinib B/C lesinurad B/C aceclofenac C CYP2C9 and NSAIDs aspirin C CYP2C9 and NSAIDs diclofenac C CYP2C9 and NSAIDs flibanserin C indomethacin C CYP2C9 and NSAIDs lumiracoxib C CYP2C9 and NSAIDs nabumetone C CYP2C9 and NSAIDs naproxen C CYP2C9 and NSAIDs Määrab *2 ja *3 ning *5, *6, *8 ja *11 alleelid, mis on Aafrika päritoluga populatsioonides kõige olulisemad. CYP2C-klastri variant rs12777823, mis selles rühmas samuti informeerib varfariini annustamist, ei ole siin hinnatud.
Kuidas CYP2C9 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2,6 kb kogupikkusega 51,4 kb; neist 1473 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: CYP2C9
5Lihtne
Kui raske on geeni CYP2C9 lühikeste lugemitega järjestada, skaalal 0–100
0 · Lihtne100 · Raske
Peaaegu kõik geeni CYP2C9 eksonid asuvad kohtades, kuhu lühikesed lugemid kaardistuvad selgelt.
Lisaks mõjutab tulemust see, kui suur osa geeni CYP2C9 eksonitest asub igat tüüpi rasketes piirkondades
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkused lugemid ei saa ühemõtteliselt paigutuda, nii et seal tehtud määramine võib puududa või olla vale. Eraldi võetuna saaks geen, mis asub täielikult sellist tüüpi piirkonnas, skoori 100.4%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: koopiad mujal genoomis, näiteks paraloogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Eraldi võetuna saaks geen, mis asub täielikult sellist tüüpi piirkonnas, skoori 60.0%
- Ühine chrY-gaPseudoautosoomsed piirkonnad ja X-transponeeritud piirkond, kus chrX ja chrY sisaldavad sama või peaaegu sama järjestust, nii et chrX-ist pärinev lugem võib paigutuda chrY-le. Eraldi võetuna saaks geen, mis asub täielikult sellist tüüpi piirkonnas, skoori 60.0%
- ViitekatvusLähedal asuvad lüngad viitekoosseisus, kus puudub järjestus, millele lugemid joonduda saaksid. Eraldi võetuna saaks geen, mis asub täielikult sellist tüüpi piirkonnas, skoori 50.0%
- KordusedTandemkordused ja ühe aluse jadad, millel lugemid libisevad ja mida need ei pruugi katta. Eraldi võetuna saaks geen, mis asub täielikult sellist tüüpi piirkonnas, skoori 30.0,7%
- GC-sisaldusAknad, kus G- ja C-aluste osakaal on alla 25% või üle 65%; raamatukogu ettevalmistus katab neid hõredalt. Eraldi võetuna saaks geen, mis asub täielikult sellist tüüpi piirkonnas, skoori 20.1,7%
Dante Labsi skoor, mis põhineb meie enda uuringul ja NISTi Genome in a Bottle kaartidel raskesti järjestatavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakseIga tulp näitab, kui suur osa geeni CYP2C9 eksonite aluspaaridest asub selles raskes piirkonnas. Iga tüüp võib geeni iseseisvalt raskeks teha, ja iga järgmine tüüp lisab vähem: 0, kui ükski aluspaar ei asu üheski, 100, kui iga aluspaar asub kohas, kuhu lugemid ei saa ühemõtteliselt paigutuda.
Geeniga CYP2C9 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida CYP2C9 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
- CPIC ja PharmGKB: alleelid, tulemused ja ravimid.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). CYP2C9 geen: cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/cyp2c9
Dante Labs. CYP2C9 geen: cytochrome P450 family 2 subfamily C member 9 [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/cyp2c9
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast