Gen
UGT1A1
UDP glucuronosyltransferase family 1 member A1
- HGNC 12530↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000241635↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 54658↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 2q37.1
- Współrzędne
- Chromosom 2: 233 760 270–233 773 300 (GRCh38)
- Eksony
- 5 eksonów na odcinku 13 kb
- Białko
- 533 aminokwasów, 59,6 kDa
- Znany również jako
- UGT1A
- Poprzednie symbole
- UGT1, GNT1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000305208.10NM_000463.3
- Typ locus
- Inne
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Share this page
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ugt1a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj UGT1A1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Zespół Gilberta
- Autosomalne recesywne
Autosomalnie recesywne dziedziczne zaburzenie charakteryzujące się niesprzężoną hiperbilirubinemią, objawiającą się nieszkodliwą, okresową żółtaczką.
- 1 podmiot w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Sam zespół Gilberta nie wymaga leczenia; konieczne może być dostosowanie dawki leków metabolizowanych przez UGT1A1
- Zespół Crigler-NajjarAutosomalne recesywne
Wywoływany przez warianty w UGT1A1, które istotnie zmniejszają przetwarzanie bilirubiny, powodując utrzymującą się, a czasem groźną żółtaczkę od urodzenia (typ 1) lub łagodniejszą żółtaczkę utrzymującą się przez całe życie (typ 2).
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Wiedza o tym pozwala na codzienną fototerapię lub przeszczep wątroby w typie 1 oraz leczenie fenobarbitalem w typie 2, aby zapobiec uszkodzeniu mózgu przez bilirubinę.
UGT1A1 a leki
Metabolizm leków irinotecan i atazanavir oraz bilirubiny
Farmakogenomika
UGT1A1 odpowiada za glukuronidację bilirubiny oraz aktywnego metabolitu leku irinotecan, a ponadto ulega hamowaniu przez lek przeciw HIV atazanavir. Obniżona aktywność enzymu (allel *28 leżący u podstaw zespołu Gilberta oraz *6) zwiększa ryzyko toksyczności leku irinotecan oraz żółtaczki wywołanej przez atazanavir.
- Najbardziej istotne w przypadku leczenia preparatem irinotecan (niektóre schematy w raku jelita grubego i przewodu pokarmowego).
- Istotne w przypadku przyjmowania leku atazanavir: obniżona aktywność enzymu zwiększa prawdopodobieństwo wystąpienia żółtaczki, która jest częstą przyczyną odstawienia leku.
- Wyjaśnia również łagodną, nieszkodliwą żółtaczkę (zespół Gilberta), która może pojawiać się podczas głodówki lub osłabienia organizmu.
- Informacja ta znajduje się również w charakterystykach niektórych leków onkologicznych, m.in. belinostat, nilotinib i pazopanib.
Allele opisywane w raporcie
- *1Normal function
- *6Decreased function
Wyniki opisywane przez CPIC
- Indeterminate
- Intermediate Metabolizer
- Normal Metabolizer
- Poor Metabolizer
Lek Poziom CPIC Wytyczne atazanavir A UGT1A1 and Atazanavir irinotecan A belinostat B Pokaż 4 kolejnych leków
Lek Poziom CPIC Wytyczne dolutegravir B/C nilotinib B/C pazopanib B/C raltegravir B/C Obejmuje analizę wariantu kodującego *6, powszechnego w populacjach wschodnioazjatyckich. Powtórzenie TA w allelu *28, odpowiedzialne za zespół Gilberta, nie może być odczytane z danych pojedynczych wariantów i zostało uwzględnione w sekcji analizy pogłębionej; rzadsze allele nie podlegają ocenie.
Budowa genu UGT1A1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 2,4 kb z 13 kb genu; 1602 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie UGT1A1
1Łatwo
Jak trudno zsekwencjonować UGT1A1 krótkimi odczytami, w skali do 100
0 · Łatwo100 · Trudno
Niemal wszystkie eksony UGT1A1 znajdują się w miejscach, które krótkie odczyty mapują bez problemu.
Co na to wpływa: udział eksonów UGT1A1 w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćOdcinki, w których odczytów 100 lub 250 bp nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 100.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o zgodności 90% lub więcej. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 60.0%
- Wspólne z chrYRegiony pseudoautosomalne i region X-transpozycji, w których chrX i chrY mają tę samą lub niemal tę samą sekwencję, dlatego odczyt z jednego może zostać przypisany do drugiego. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 60.0%
- Pokrycie sekwencji referencyjnejLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, w których nie ma sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 50.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i ciągi jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 30.1,6%
- Zawartość GCOkna z poniżej 25% lub powyżej 65% G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 20.0,2%
Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynikKażdy słupek to udział zasad eksonów UGT1A1 w danym rodzaju trudnego regionu. Każdy rodzaj może sam w sobie uczynić gen trudnym, a każdy kolejny dodaje coraz mniej: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w żadnym z nich, 100, gdy każda zasada leży tam, gdzie odczytów nie da się jednoznacznie umieścić.
48
pozycje w UGT1A1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, z którym krótkie odczyty mają trudności.
Genom w całości obejmuje wszystkie 13 kb genu UGT1A1, łącznie z intronami, a nie tylko 2,4 kb eksonów.
Patogenne warianty ClinVar (50)
Warianty UGT1A1, które ClinVar klasyfikuje jako patogenne lub prawdopodobnie patogenne w odniesieniu do dowolnej choroby, zweryfikowane przez co najmniej jednego zgłaszającego według kryteriów, oraz te spośród nich, które zostały najczęściej zweryfikowane. Jest to publiczny zapis ClinVar dotyczący genu, a nie wynik badania.
- Patogenny 17
- Patogenny/prawdopodobnie patogenny 6
- Prawdopodobnie patogenny 27
| Wariant | Choroby | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|
| NM_000463.3(UGT1A1):c.222C>A (p.Tyr74Ter) | Crigler-Najjar syndrome | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.625C>T (p.Arg209Trp) | Crigler-Najjar syndrome i 4 innych | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.923G>A (p.Gly308Glu) | Gilbert syndrome | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.1021C>T (p.Arg341Ter) | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 3 innych | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.1220del (p.Lys407fs) | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 3 innych | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.1304+1G>T | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 3 innych | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.1456T>G (p.Tyr486Asp) | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 4 innych | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.864+1G>A | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 3 innych | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.1007G>A (p.Arg336Gln) | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 3 innych | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.238_239insGTAC (p.Pro80fs) | hyperbilirubinemia | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.247T>C (p.Phe83Leu) | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 1 inna choroba | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.353dup (p.Asp119fs) | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 1 inna choroba | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.622_625dup (p.Arg209fs) | Crigler-Najjar syndrome | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.652dup (p.Ser218fs) | Crigler-Najjar syndrome | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.722_723del (p.Glu241fs) | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 4 innych | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.725del (p.Val242fs) | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 3 innych | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.826G>C (p.Gly276Arg) | Crigler-Najjar syndrome type 2 | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.835A>T (p.Asn279Tyr) | Crigler-Najjar syndrome type 2 | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.847C>T (p.Gln283Ter) | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 3 innych | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.877_883del (p.Tyr293fs) | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 3 innych | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.1006C>T (p.Arg336Trp) | Crigler-Najjar syndrome | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.1084+1G>T | hyperbilirubinemia | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.1124C>T (p.Ser375Phe) | Crigler-Najjar syndrome | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.1184G>T (p.Gly395Val) | Crigler-Najjar syndrome | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_000463.3(UGT1A1):c.1305-1G>A | Crigler-Najjar syndrome type 1 i 3 innych | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
Zobacz wszystkie 50 razem z każdym innym wariantem UGT1A1 w ClinVar → (otwiera się w nowej karcie)
Cechy powiązane z genem UGT1A1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać UGT1A1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-21: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- CPIC i PharmGKB: allele, wyniki i leki.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.21-311f020e.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen UGT1A1: UDP glucuronosyltransferase family 1 member A1. Pobrano 21 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/ugt1a1
Dante Labs. Gen UGT1A1: UDP glucuronosyltransferase family 1 member A1 [Internet]. [cytowano 21 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/ugt1a1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni