Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

ATG16L1

autophagy related 16 like 1

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
2q37.1
Współrzędne
Chromosom 2: 233 251 673–233 295 669 (GRCh38)
Eksony
18 eksonów na odcinku 44 kb
Białko
607 aminokwasów
Znany również jako
WDR30, FLJ10035, ATG16A
Poprzednie symbole
APG16L, ATG16L
Transkrypt MANE Select
ENST00000392017.9NM_030803.7
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu ATG16L1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu ATG16L1

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 2, z nawiasem wskazującym położenie ATG16L1. ATG16L1 i 18 genów w pobliżu na chromosomie 2, od 232 773 671 do 233 773 670.Chromosom 22q37.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3232,8 Mb233 Mb233,2 Mb233,4 Mb233,6 MbGIGYF2: 232 697 259–232 863 338, nić dodatniejGIGYF2KCNJ13: 232 765 802–232 776 566, nić ujemnejKCNJ13SNORC: 232 857 270–232 878 708, nić dodatniejSNORCNGEF: 232 878 686–233 013 263, nić ujemnejNGEFNEU2: 233 023 032–233 042 480, nić dodatniejNEU2INPP5D: 233 059 967–233 207 903, nić dodatniejINPP5DATG16L1: 233 251 673–233 295 669, nić dodatniejATG16L1SAG: 233 307 816–233 347 055, nić dodatniejSAGDGKD: 233 354 475–233 472 104, nić dodatniejDGKDUSP40: 233 475 526–233 566 783, nić ujemnejUSP40UGT1A8: 233 617 633–233 773 310, nić dodatniejUGT1A8UGT1A10: 233 636 447–233 773 310, nić dodatniejUGT1A10UGT1A9: 233 671 734–233 773 310, nić dodatniejUGT1A9UGT1A7: 233 681 885–233 773 310, nić dodatniejUGT1A7UGT1A6: 233 691 607–233 773 300, nić dodatniejUGT1A5: 233 712 907–233 773 310, nić dodatniejUGT1A4: 233 718 727–233 773 310, nić dodatniejUGT1A3: 233 729 042–233 773 310, nić dodatniejUGT1A1: 233 760 262–233 773 313, nić dodatniejSchemat ATG16L1: 18 eksonów na nici dodatniej chromosomu 2Ekson 1: 233 251 673–233 251 942, 270 zasadEkson 2: 233 256 102–233 256 195, 94 zasadEkson 3: 233 263 130–233 263 235, 106 zasadEkson 4: 233 263 992–233 264 065, 74 zasadEkson 5: 233 264 892–233 265 143, 252 zasadEkson 6: 233 270 002–233 270 067, 66 zasadEkson 7: 233 272 966–233 273 052, 87 zasadEkson 8: 233 273 721–233 273 777, 57 zasadEkson 9: 233 274 676–233 274 778, 103 zasadEkson 10: 233 277 568–233 277 673, 106 zasadEkson 11: 233 281 105–233 281 175, 71 zasadEkson 12: 233 282 682–233 282 753, 72 zasadEkson 13: 233 289 854–233 289 974, 121 zasadEkson 14: 233 290 248–233 290 353, 106 zasadEkson 15: 233 292 128–233 292 277, 150 zasadEkson 16: 233 292 387–233 292 434, 48 zasadEkson 17: 233 293 256–233 293 357, 102 zasadEkson 18: 233 294 257–233 295 669, 1413 zasad1246810121416185′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 3,3 kb z 44 kb genu; 1824 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie ATG16L1

2Łatwo

Jak trudno zsekwencjonować ATG16L1 krótkimi odczytami, w skali do 100

Niemal wszystkie eksony ATG16L1 znajdują się w miejscach, które krótkie odczyty mapują bez problemu.

Co na to wpływa: udział eksonów ATG16L1 w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność0%
  • Homologia0%
  • Wspólne z chrY0%
  • Pokrycie sekwencji referencyjnej0%
  • Powtórzenia1,5%
  • Zawartość GC8,2%

Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynik

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen ATG16L1: autophagy related 16 like 1. Pobrano 20 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/atg16l1

Vancouver

Dante Labs. Gen ATG16L1: autophagy related 16 like 1 [Internet]. [cytowano 20 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/atg16l1

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test