Gen
POPDC1
popeye domain cAMP effector 1
- HGNC 1152↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000112276↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 11149↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 6q21
- Coördinaten
- Chromosoom 6: 105.096.822–105.137.157 (GRCh38)
- Exons
- 8 exons over 40,3 kb
- Eiwit
- 360 aminozuren
- Ook bekend als
- POP1, HBVES
- Eerdere symbolen
- BVES
- MANE Select-transcript
- ENST00000314641.10NM_001199563.2
- Type locus
- gene with protein product
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees POPDC1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Gordelspierdystrofie
Gordelspierdystrofie wordt gedefinieerd als een verzameling van talrijke subtypen met verschillende overervingspatronen (waarbij ook de mate waarin een diagnose met zekerheid kan worden gesteld, varieert). Dragers van varianten die verband houden met deze aandoening dienen advies in te winnen bij een specialist in de spier- en skeletaandoeningen voor een definitieve diagnose.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van POPDC1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 5,6 kb van de 40,3 kb van het gen; 1.083 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest POPDC1 leest
5
posities in POPDC1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 40,3 kb van POPDC1, inclusief introns, en niet alleen de 5,6 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ANO5anoctamin 5Deelt 1 aandoening
- CAPN3calpain 3Deelt 1 aandoening
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainDeelt 1 aandoening
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainDeelt 1 aandoening
- DAG1dystroglycan 1Deelt 1 aandoening
- DNAJB6DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6Deelt 1 aandoening
- DYSFdysferlinDeelt 1 aandoening
- FKRPfukutin related proteinDeelt 1 aandoening
- FKTNfukutinDeelt 1 aandoening
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BDeelt 1 aandoening
- HMGCR3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductaseDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan POPDC1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die POPDC1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). POPDC1-gen: popeye domain cAMP effector 1. Geraadpleegd op 16 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/popdc1
Dante Labs. POPDC1-gen: popeye domain cAMP effector 1 [Internet]. [geraadpleegd 16 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/popdc1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken