동료 심사 완료 · PNAS Nexus · 2022
The genomic prehistory of the Indigenous peoples of Uruguay
이 연구는 우루과이 동부의 2,000년 된 유적지에서 발굴된 유골을 토대로, 유럽인이 도래하기 이전 우루과이 원주민의 전장 유전체 서열을 처음으로 제시합니다. 이 개인들은 파나마와 브라질 동부의 고대 개인들과 연관이 있었지만 현대 아마존 원주민과는 연관성이 없었으며, 남아메리카에서 이전에 검출되지 않았던 뚜렷이 구별되는 조상 계통을 지니고 있었습니다.
Lindo et al.
이 연구는 우루과이 동부의 2,000년 된 유적지에서 발굴된 유골을 토대로, 유럽인이 도래하기 이전 우루과이 원주민의 전장 유전체 서열을 처음으로 제시합니다. 이 개인들은 파나마와 브라질 동부의 고대 개인들과 연관이 있었지만 현대 아마존 원주민과는 연관성이 없었으며, 남아메리카에서 이전에 검출되지 않았던 뚜렷이 구별되는 조상 계통을 지니고 있었습니다.
Dante Labs의 참여 내용
Dante Labs는 이 연구의 심층 시퀀싱을 수행했습니다. 심층 시퀀싱 대상으로 선정된 시료는 이탈리아 라킬라에 있는 당사 시설의 Illumina NovaSeq 6000 플랫폼에서 분석되었으며, 여기에는 DNA 손상을 보완하기 위해 USER 효소로 처리한 라이브러리도 포함되었습니다.
추출 및 라이브러리 준비는 Emory University의 Lindo Ancient DNA 연구소 연구팀이 고대 DNA에 맞게 수정한 Dabney 프로토콜과 Illumina용 NEB Ultra II DNA Library Prep 키트를 사용하여 수행했습니다. 내인성 DNA에 대한 예비 스크리닝은 Lindo 연구소에서 Illumina iSeq 100으로 실시했습니다. Dante Labs의 기여는 선별된 라이브러리의 심층 시퀀싱이었습니다.
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