Peer-Review · PNAS Nexus · 2022
The genomic prehistory of the Indigenous peoples of Uruguay
Diese Studie präsentiert die ersten vollständigen Genomsequenzen indigener Menschen aus Uruguay aus der Zeit vor dem Kontakt mit Europäern. Sie stammen von einer 2.000 Jahre alten Fundstätte im Osten Uruguays. Die untersuchten Personen waren genetisch mit Menschen aus dem alten Panama und dem Osten Brasiliens verwandt, nicht jedoch mit heutigen Bevölkerungsgruppen Amazoniens, und wiesen eine eigenständige Abstammung auf, die zuvor in Südamerika nicht nachgewiesen worden war.
Lindo et al.
Diese Studie präsentiert die ersten vollständigen Genomsequenzen indigener Menschen aus Uruguay aus der Zeit vor dem Kontakt mit Europäern. Sie stammen von einer 2.000 Jahre alten Fundstätte im Osten Uruguays. Die untersuchten Personen waren genetisch mit Menschen aus dem alten Panama und dem Osten Brasiliens verwandt, nicht jedoch mit heutigen Bevölkerungsgruppen Amazoniens, und wiesen eine eigenständige Abstammung auf, die zuvor in Südamerika nicht nachgewiesen worden war.
Beteiligung von Dante Labs
Dante Labs führte die Tiefensequenzierung für diese Studie durch. Die für die Tiefensequenzierung ausgewählten Proben wurden auf unserer Illumina NovaSeq 6000-Plattform in unserer Einrichtung in L'Aquila, Italien, analysiert. Dazu gehörten auch Bibliotheken, die mit dem USER-Enzym behandelt wurden, um DNA-Schäden auszugleichen.
Die Extraktion und Bibliotheksvorbereitung wurden vom Forschungsteam des Lindo Ancient DNA Laboratory an der Emory University unter Verwendung des Dabney-Protokolls und des NEB Ultra II DNA Library Prep Kit for Illumina mit Anpassungen für alte DNA durchgeführt. Das vorläufige Screening auf endogene DNA erfolgte auf einem Illumina iSeq 100 im Lindo Lab. Der Beitrag von Dante Labs bestand in der Tiefensequenzierung der ausgewählten Bibliotheken.
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