Revisado por pares · PNAS Nexus · 2022
The genomic prehistory of the Indigenous peoples of Uruguay
Este estudio presenta las primeras secuencias del genoma completo de pueblos indígenas de Uruguay anteriores al contacto con los europeos, procedentes de un yacimiento de hace 2.000 años situado en el este del país. Los individuos estaban emparentados con individuos antiguos de Panamá y del este de Brasil, pero no con poblaciones amazónicas modernas, y presentaban una ascendencia diferenciada que no se había detectado anteriormente en Sudamérica.
Lindo et al.
Este estudio presenta las primeras secuencias del genoma completo de pueblos indígenas de Uruguay anteriores al contacto con los europeos, procedentes de un yacimiento de hace 2.000 años situado en el este del país. Los individuos estaban emparentados con individuos antiguos de Panamá y del este de Brasil, pero no con poblaciones amazónicas modernas, y presentaban una ascendencia diferenciada que no se había detectado anteriormente en Sudamérica.
Participación de Dante Labs
Dante Labs llevó a cabo la secuenciación profunda para este estudio. Las muestras seleccionadas para la secuenciación profunda se procesaron en nuestra plataforma Illumina NovaSeq 6000, en nuestras instalaciones de L'Aquila, Italia; entre ellas se incluyeron bibliotecas tratadas con la enzima USER para ayudar a compensar los daños en el ADN.
La extracción y la preparación de las bibliotecas fueron realizadas por el equipo de investigación del laboratorio Lindo Ancient DNA de Emory University, utilizando el protocolo Dabney y el kit NEB Ultra II DNA Library Prep para Illumina, con modificaciones para ADN antiguo; el cribado preliminar de ADN endógeno se llevó a cabo en un Illumina iSeq 100 en el Lindo Lab. La contribución de Dante Labs consistió en la secuenciación profunda de las bibliotecas seleccionadas.
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