Revisto por pares · PNAS Nexus · 2022
The genomic prehistory of the Indigenous peoples of Uruguay
Este estudo apresenta as primeiras sequências do genoma completo de povos indígenas do Uruguai anteriores ao contacto com os europeus, provenientes de um sítio arqueológico com 2.000 anos no leste do país. Os indivíduos estavam geneticamente relacionados com indivíduos antigos do Panamá e do leste do Brasil, mas não com populações amazónicas modernas, e apresentavam uma ancestralidade distinta, até então não detetada na América do Sul.
Lindo et al.
Este estudo apresenta as primeiras sequências do genoma completo de povos indígenas do Uruguai anteriores ao contacto com os europeus, provenientes de um sítio arqueológico com 2.000 anos no leste do país. Os indivíduos estavam geneticamente relacionados com indivíduos antigos do Panamá e do leste do Brasil, mas não com populações amazónicas modernas, e apresentavam uma ancestralidade distinta, até então não detetada na América do Sul.
Participação da Dante Labs
A Dante Labs realizou a sequenciação profunda para este estudo. As amostras selecionadas para sequenciação profunda foram processadas na nossa plataforma Illumina NovaSeq 6000, nas nossas instalações em L'Aquila, Itália; estas incluíram bibliotecas tratadas com a enzima USER para ajudar a compensar os danos no DNA.
A extração e a preparação das bibliotecas foram realizadas pela equipa de investigação no laboratório Lindo Ancient DNA da Emory University, utilizando o protocolo Dabney e o kit NEB Ultra II DNA Library Prep para Illumina, com adaptações para ADN antigo; a análise preliminar para deteção de ADN endógeno foi realizada num Illumina iSeq 100 no Lindo Lab. O contributo da Dante Labs consistiu na sequenciação profunda das bibliotecas selecionadas.
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