Évalué par les pairs · PNAS Nexus · 2022
The genomic prehistory of the Indigenous peoples of Uruguay
Cette étude présente les premières séquences de génomes complets de peuples autochtones d’Uruguay datant d’avant le contact avec les Européens, issues d’un site vieux de 2 000 ans situé dans l’est du pays. Ces individus présentaient des liens avec des individus anciens du Panama et de l’est du Brésil, mais pas avec les populations amazoniennes actuelles, et possédaient une ascendance distincte qui n’avait encore jamais été détectée en Amérique du Sud.
Lindo et al.
Cette étude présente les premières séquences de génomes complets de peuples autochtones d’Uruguay datant d’avant le contact avec les Européens, issues d’un site vieux de 2 000 ans situé dans l’est du pays. Ces individus présentaient des liens avec des individus anciens du Panama et de l’est du Brésil, mais pas avec les populations amazoniennes actuelles, et possédaient une ascendance distincte qui n’avait encore jamais été détectée en Amérique du Sud.
Participation de Dante Labs
Dante Labs a réalisé le séquençage en profondeur pour cette étude. Les échantillons sélectionnés ont été séquencés sur notre plateforme Illumina NovaSeq 6000 dans notre laboratoire de L'Aquila, en Italie. Ils comprenaient des banques traitées avec l’enzyme USER afin de contribuer à compenser les dommages subis par l’ADN.
L’extraction et la préparation des banques ont été réalisées par l’équipe de recherche du laboratoire Lindo Ancient DNA de l’Emory University, selon le protocole de Dabney et à l’aide du kit NEB Ultra II DNA Library Prep pour Illumina, adapté à l’ADN ancien ; un criblage préliminaire visant à détecter l’ADN endogène a été effectué sur un Illumina iSeq 100 au Lindo Lab. La contribution de Dante Labs a consisté à réaliser le séquençage en profondeur des banques sélectionnées.
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