Gene
SLC18A2
solute carrier family 18 member A2
- HGNC 10935↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000165646↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 6571↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 10q25.3
- Coordinate
- Cromosoma 10: 117.241.114–117.279.430 (GRCh38)
- Esoni
- 16 esoni su 38,3 kb
- Proteina
- 514 amminoacidi
- Noto anche come
- SVMT, SVAT, VAT2
- Simboli precedenti
- VMAT2
- Trascritto MANE Select
- ENST00000644641.2NM_003054.6
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Deficit di BH4 e disturbi dei neurotrasmettitori monoaminergici
- Disturbi congeniti del metabolismo e del trasporto dei neurotrasmettitori
Include il deficit di decarbossilasi degli L-aminoacidi aromatici (AADC), il deficit di tirosina idrossilasi e la malattia del trasportatore vescicolare delle monoamine (SLC18A2), che possono causare disturbi del movimento, ipotonia e ritardo dello sviluppo.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Conoscere la condizione consente trattamenti mirati, come la L-dopa per il deficit di tirosina idrossilasi o la terapia genica per il deficit di AADC.
Distonia, miotonia, discinesia parossistica
- Distonia ereditaria
Termine generico che comprende le distonie ereditarie, tra cui la distonia generalizzata a esordio precoce DYT-TOR1A, DYT-THAP1, la mioclono-distonia (SGCE) e la distonia correlata a KMT2B.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Struttura di SLC18A2
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 3,8 kb dei 38,3 kb del gene; 1545 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge SLC18A2
5
posizioni in SLC18A2 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 38,3 kb di SLC18A2, introni inclusi, non solo i 3,8 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ACTBactin betaCondivide 1 condizione
- ANO3anoctamin 3Condivide 1 condizione
- ARFGEF3ARFGEF family member 3Condivide 1 condizione
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Condivide 1 condizione
- BCAP31B cell receptor associated protein 31Condivide 1 condizione
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainCondivide 1 condizione
- DBHdopamine beta-hydroxylaseCondivide 1 condizione
- DCAF17DDB1 and CUL4 associated factor 17Condivide 1 condizione
- DDCdopa decarboxylaseCondivide 1 condizione
- GCH1GTP cyclohydrolase 1Condivide 1 condizione
- GNALG protein subunit alpha LCondivide 1 condizione
- HPCAhippocalcinCondivide 1 condizione
Tratti collegati a SLC18A2
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SLC18A2 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Delayed ability to sit
- Delayed ability to walk
- Difficulty articulating speech
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Difficulty sleeping
- Dystonia
- Global developmental delay
Mostra altri 15 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene SLC18A2: solute carrier family 18 member A2. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/slc18a2
Dante Labs. Gene SLC18A2: solute carrier family 18 member A2 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/slc18a2
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