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Gène

TRAPPC2L

trafficking protein particle complex subunit 2L

Résumé

Localisation cytogénétique
16q24.3
Coordonnées
Chromosome 16 : 88 857 127–88 862 678 (GRCh38)
Exons
5 exons sur 5,6 kb
Protéine
139 acides aminés
Aussi appelé
HSPC176
Transcrit MANE Select
ENST00000696289.1NM_001318525.2
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TRAPPC2L. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TRAPPC2L

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
Chromosome 16, avec un crochet à l'emplacement de TRAPPC2L. TRAPPC2L et 21 gènes à proximité sur le chromosome 16, de 88 359 903 à 89 359 902.Chromosome 1616q24.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.388,4 Mb88,6 Mb88,8 Mb89 Mb89,2 MbZNF469 : 88 382 959–88 440 757, brin directZNF469ZFPM1 : 88 453 208–88 537 031, brin directZFPM1ZC3H18 : 88 570 388–88 631 966, brin directZC3H18IL17C : 88 638 571–88 640 468, brin directIL17CCYBA : 88 643 275–88 651 083, brin inverseCYBAMVD : 88 651 934–88 663 166, brin inverseMVDSNAI3 : 88 674 992–88 686 513, brin inverseSNAI3RNF166 : 88 696 494–88 706 424, brin inverseRNF166CTU2 : 88 706 470–88 717 853, brin directCTU2PIEZO1 : 88 715 338–88 785 251, brin inversePIEZO1CDT1 : 88 803 777–88 809 258, brin directCDT1APRT : 88 808 323–88 811 970, brin inverseAPRTGALNS : 88 813 733–88 857 832, brin inverseGALNSTRAPPC2L : 88 857 127–88 862 678, brin directTRAPPC2LPABPN1L : 88 863 333–88 866 660, brin inversePABPN1LCBFA2T3 : 88 874 858–88 977 207, brin inverseCBFA2T3ACSF3 : 89 088 375–89 164 121, brin directACSF3CDH15 : 89 171 742–89 195 492, brin directCDH15SLC22A31 : 89 195 458–89 201 692, brin inverseSLC22A31ZNF778 : 89 217 683–89 237 141, brin directZNF778ANKRD11 : 89 267 619–89 490 706, brin inverseANKRD11 : 89 317 046–89 418 292, brin inverseSchéma de TRAPPC2L : 5 exons sur le brin direct du chromosome 16Exon 2 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 88 857 127–88 857 183, 57 basesExon 2 : 88 858 619–88 858 791, 173 basesExon 3 : 88 859 663–88 859 750, 88 basesExon 4 : 88 859 893–88 859 972, 80 basesExon 5 : 88 860 914–88 862 678, 1 765 bases123455′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,2 kb sur les 5,6 kb du gène ; 420 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit TRAPPC2L

5

positions dans TRAPPC2L où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

1 d'entre elles (20 %) se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

  • Low mappability (1 site)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.

Un génome entier couvre les 5,6 kb de TRAPPC2L, introns compris, et pas seulement les 2,2 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène TRAPPC2L : trafficking protein particle complex subunit 2L. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/trappc2l

Vancouver

Dante Labs. Gène TRAPPC2L : trafficking protein particle complex subunit 2L [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/trappc2l

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