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Gène

LOXL3

lysyl oxidase like 3

Résumé

Localisation cytogénétique
2p13.1
Coordonnées
Chromosome 2 : 74 532 258–74 553 942 (GRCh38)
Exons
14 exons sur 21,7 kb
Protéine
753 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000264094.8NM_032603.5
Type de locus
Protein-coding
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore LOXL3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de LOXL3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 2, avec un crochet à l'emplacement de LOXL3. LOXL3 et 29 gènes à proximité sur le chromosome 2, de 74 043 100 à 75 043 099.Chromosome 22p13.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.374,2 Mb74,4 Mb74,6 Mb74,8 Mb75 MbTET3 : 73 984 910–74 108 177, brin directTET3BOLA3 : 74 133 333–74 147 977, brin inverseBOLA3MOB1A : 74 152 528–74 178 932, brin inverseMOB1AMTHFD2 : 74 186 172–74 218 432, brin directMTHFD2 : 74 211 604–74 363 377, brin inverseSLC4A5 : 74 216 242–74 343 416, brin inverseSLC4A5DCTN1 : 74 361 154–74 392 087, brin inverseDCTN1 : 74 393 836–74 421 662, brin inverseC2orf81 : 74 414 176–74 421 655, brin inverseWDR54 : 74 421 477–74 425 770, brin directRTKN : 74 424 131–74 442 422, brin inverseINO80B : 74 455 078–74 457 958, brin directINO80B-WBP1 : 74 455 088–74 460 884, brin directWBP1 : 74 458 263–74 461 077, brin directMOGS : 74 461 057–74 465 415, brin inverseMOGSCCDC142 : 74 471 957–74 483 408, brin inverseCCDC142MRPL53 : 74 471 957–74 472 699, brin inverseMRPL53TTC31 : 74 482 617–74 496 915, brin directLBX2 : 74 497 455–74 503 316, brin inversePCGF1 : 74 505 041–74 508 361, brin inverseTLX2 : 74 513 463–74 517 148, brin directDQX1 : 74 518 131–74 526 396, brin inverseAUP1 : 74 526 636–74 529 966, brin inverseAUP1HTRA2 : 74 529 274–74 533 966, brin directHTRA2LOXL3 : 74 532 258–74 553 942, brin inverseLOXL3DOK1 : 74 548 875–74 557 554, brin directDOK1M1AP : 74 557 883–74 648 350, brin inverseM1APSEMA4F : 74 654 226–74 707 584, brin directSEMA4FHK2 : 74 834 077–74 893 359, brin directHK2POLE4 : 74 958 636–75 147 205, brin directPOLE4Schéma de LOXL3 : 14 exons sur le brin inverse du chromosome 2Exon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 5 : 1 site connu associé à une maladieExon 3 : 1 site connu associé à une maladieExon 14 : 74 532 258–74 533 679, 1 422 basesExon 13 : 74 533 882–74 533 993, 112 basesExon 12 : 74 534 100–74 534 236, 137 basesExon 11 : 74 534 316–74 534 431, 116 basesExon 10 : 74 534 531–74 534 774, 244 basesExon 9 : 74 535 292–74 535 454, 163 basesExon 8 : 74 535 588–74 535 755, 168 basesExon 7 : 74 535 996–74 536 150, 155 basesExon 6 : 74 536 291–74 536 471, 181 basesExon 5 : 74 536 709–74 536 928, 220 basesExon 4 : 74 549 369–74 549 583, 215 basesExon 3 : 74 550 185–74 550 348, 164 basesExon 2 : 74 552 322–74 552 646, 325 basesExon 1 : 74 553 876–74 553 942, 67 bases1410515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,7 kb sur les 21,7 kb du gène ; 2 262 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de LOXL3

4

positions de LOXL3 où ClinVar classe une variante comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 21,7 kb de LOXL3, introns compris, et pas seulement les 3,7 kb d'exons.

Traits associés à LOXL3

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que LOXL3 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.17-8666dff2.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène LOXL3 : lysyl oxidase like 3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/loxl3

Vancouver

Dante Labs. Gène LOXL3 : lysyl oxidase like 3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/loxl3

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