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Gène

HOXB13

homeobox B13

Résumé

Localisation cytogénétique
17q21.32
Coordonnées
Chromosome 17 : 48 724 763–48 728 750 (GRCh38)
Exons
2 exons sur 4 kb
Protéine
284 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000290295.8NM_006361.6
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

  • Cancer héréditaire de la prostate

    • Cancer de la prostate
      • 2 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
      Ce que la connaissance change

      Dépistage précoce par dosage du PSA dès 40 ans, traitement par inhibiteurs de PARP pour les porteurs d'une mutation BRCA2, dépistage en cascade familial, adaptation du protocole de surveillance

Structure de HOXB13

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de HOXB13. HOXB13 et 23 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 48 226 757 à 49 226 756.Chromosome 1717q21.32p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.348,4 Mb48,6 Mb48,8 Mb49 Mb49,2 MbSKAP1 : 48 133 433–48 430 275, brin inverseSKAP1HOXB1 : 48 528 526–48 531 011, brin inverseHOXB1HOXB2 : 48 540 894–48 545 115, brin inverseHOXB2HOXB3 : 48 548 870–48 604 912, brin inverseHOXB4 : 48 575 507–48 578 429, brin inverseHOXB5 : 48 591 257–48 594 179, brin inverseHOXB6 : 48 595 525–48 605 011, brin inverseHOXB6HOXB7 : 48 607 222–48 633 572, brin inverseHOXB7HOXB8 : 48 611 377–48 618 003, brin inverseHOXB8HOXB9 : 48 621 156–48 626 576, brin inverseHOXB9PRAC2 : 48 720 813–48 724 767, brin directPRAC2PRAC1 : 48 721 719–48 723 082, brin inversePRAC1HOXB13 : 48 724 763–48 728 750, brin inverseHOXB13TTLL6 : 48 762 234–48 817 229, brin inverseTTLL6CALCOCO2 : 48 830 971–48 872 910, brin directCALCOCO2ATP5MC1 : 48 892 765–48 895 875, brin directATP5MC1UBE2Z : 48 908 368–48 929 062, brin directUBE2ZSNF8 : 48 928 972–48 944 842, brin inverseSNF8GIP : 48 958 554–48 968 596, brin inverseGIPIGF2BP1 : 48 997 225–49 056 148, brin directIGF2BP1B4GALNT2 : 49 132 460–49 178 647, brin directB4GALNT2GNGT2 : 49 202 791–49 210 610, brin inverseGNGT2ABI3 : 49 210 388–49 224 184, brin directABI3PHOSPHO1 : 49 223 346–49 230 831, brin inversePHOSPHO1Schéma de HOXB13 : 2 exons sur le brin inverse du chromosome 17Exon 2 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 1 site connu associé à une maladieExon 2 : 48 724 763–48 727 043, 2 281 basesExon 1 : 48 727 993–48 728 750, 758 bases215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3 kb sur les 4 kb du gène ; 855 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit HOXB13

2

positions dans HOXB13 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 4 kb de HOXB13, introns compris, et pas seulement les 3 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gène HOXB13 : homeobox B13. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/hoxb13

Vancouver

Dante Labs. Gène HOXB13 : homeobox B13 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/hoxb13

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