Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

HOXB13

homeobox B13

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
17q21.32
Koordinater
Kromosom 17: 48 724 763–48 728 750 (GRCh38)
Eksoner
2 eksoner over 4 kb
Protein
284 aminosyrer
MANE Select-transkripsjon
ENST00000290295.8NM_006361.6
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Kuratert rapport som er relevant for dette genet

  • Arvelig prostatakreft

    • Prostatakreft
      • 2 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
      Handlingsnytte

      Tidlig PSA-screening fra 40 år, PARP-hemmerbehandling for BRCA2-bærere, kaskadetesting, justering av oppfølgingsprogram

Slik er HOXB13 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
Kromosom 17, med en parentes der HOXB13 står. HOXB13 og 23 gener i nærheten på kromosom 17, fra 48 226 757 til 49 226 756.Kromosom 1717q21.32p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.348,4 Mb48,6 Mb48,8 Mb49 Mb49,2 MbSKAP1: 48 133 433–48 430 275, bakover-strengSKAP1HOXB1: 48 528 526–48 531 011, bakover-strengHOXB1HOXB2: 48 540 894–48 545 115, bakover-strengHOXB2HOXB3: 48 548 870–48 604 912, bakover-strengHOXB4: 48 575 507–48 578 429, bakover-strengHOXB5: 48 591 257–48 594 179, bakover-strengHOXB6: 48 595 525–48 605 011, bakover-strengHOXB6HOXB7: 48 607 222–48 633 572, bakover-strengHOXB7HOXB8: 48 611 377–48 618 003, bakover-strengHOXB8HOXB9: 48 621 156–48 626 576, bakover-strengHOXB9PRAC2: 48 720 813–48 724 767, fremover-strengPRAC2PRAC1: 48 721 719–48 723 082, bakover-strengPRAC1HOXB13: 48 724 763–48 728 750, bakover-strengHOXB13TTLL6: 48 762 234–48 817 229, bakover-strengTTLL6CALCOCO2: 48 830 971–48 872 910, fremover-strengCALCOCO2ATP5MC1: 48 892 765–48 895 875, fremover-strengATP5MC1UBE2Z: 48 908 368–48 929 062, fremover-strengUBE2ZSNF8: 48 928 972–48 944 842, bakover-strengSNF8GIP: 48 958 554–48 968 596, bakover-strengGIPIGF2BP1: 48 997 225–49 056 148, fremover-strengIGF2BP1B4GALNT2: 49 132 460–49 178 647, fremover-strengB4GALNT2GNGT2: 49 202 791–49 210 610, bakover-strengGNGT2ABI3: 49 210 388–49 224 184, fremover-strengABI3PHOSPHO1: 49 223 346–49 230 831, bakover-strengPHOSPHO1Diagram av HOXB13: 2 eksoner på bakover-strengen til kromosom 17Ekson 2: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 1: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 2: 48 724 763–48 727 043, 2 281 baserEkson 1: 48 727 993–48 728 750, 758 baser215′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 3 kb av genets 4 kb, og 855 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av HOXB13

2

posisjoner i HOXB13 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen

Ingen av dem ligger i et område som korte leser har problemer med.

En helgenomsekvensering dekker alle 4 kb av HOXB13, inkludert introner, ikke bare de 3 kb med eksoner.

ClinVar pathogenic variants (2)

The HOXB13 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.

  • Patogen/sannsynligvis patogen 1
  • Sannsynligvis patogen 1
VariantConditionsClinVar-klassifiseringVurderingsstatus
NM_006361.6(HOXB13):c.251G>A (p.Gly84Glu) (opens in a new tab)prostate cancer, hereditary and 1 otherPatogen/sannsynligvis patogen2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter
NM_006361.6(HOXB13):c.853del (p.Ter285LysextTer?) (opens in a new tab)prostate cancer, hereditary and 1 otherSannsynligvis patogen2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-18: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
  • ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
  • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
  • Datautgave 2026.10.18-8b139e39.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). HOXB13-genet: homeobox B13. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/hoxb13

Vancouver

Dante Labs. HOXB13-genet: homeobox B13 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/hoxb13

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test