Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

HOXB13

homeobox B13

Sammanfattning

Cytogenetisk position
17q21.32
Koordinater
Kromosom 17: 48 724 763–48 728 750 (GRCh38)
Exoner
2 exoner på 4 kb
Protein
284 aminosyror
MANE Select-transkript
ENST00000290295.8NM_006361.6
Lokustyp
Proteinkodande
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterad rapport som är relevant för denna gen

  • Ärftlig prostatacancer

    • Prostatacancer
      • 2 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
      Åtgärdbarhet

      Tidig PSA-screening från 40 års ålder, PARP-hämmarbehandling för BRCA2-bärare, anhörigtestning, anpassning av uppföljningsprotokoll

Så är HOXB13 uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
Kromosom 17, med en parentes där HOXB13 finns. HOXB13 och 23 gener i närheten på kromosom 17, från 48 226 757 till 49 226 756.Kromosom 1717q21.32p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.348,4 Mb48,6 Mb48,8 Mb49 Mb49,2 MbSKAP1: 48 133 433–48 430 275, bakåt-strängSKAP1HOXB1: 48 528 526–48 531 011, bakåt-strängHOXB1HOXB2: 48 540 894–48 545 115, bakåt-strängHOXB2HOXB3: 48 548 870–48 604 912, bakåt-strängHOXB4: 48 575 507–48 578 429, bakåt-strängHOXB5: 48 591 257–48 594 179, bakåt-strängHOXB6: 48 595 525–48 605 011, bakåt-strängHOXB6HOXB7: 48 607 222–48 633 572, bakåt-strängHOXB7HOXB8: 48 611 377–48 618 003, bakåt-strängHOXB8HOXB9: 48 621 156–48 626 576, bakåt-strängHOXB9PRAC2: 48 720 813–48 724 767, framåt-strängPRAC2PRAC1: 48 721 719–48 723 082, bakåt-strängPRAC1HOXB13: 48 724 763–48 728 750, bakåt-strängHOXB13TTLL6: 48 762 234–48 817 229, bakåt-strängTTLL6CALCOCO2: 48 830 971–48 872 910, framåt-strängCALCOCO2ATP5MC1: 48 892 765–48 895 875, framåt-strängATP5MC1UBE2Z: 48 908 368–48 929 062, framåt-strängUBE2ZSNF8: 48 928 972–48 944 842, bakåt-strängSNF8GIP: 48 958 554–48 968 596, bakåt-strängGIPIGF2BP1: 48 997 225–49 056 148, framåt-strängIGF2BP1B4GALNT2: 49 132 460–49 178 647, framåt-strängB4GALNT2GNGT2: 49 202 791–49 210 610, bakåt-strängGNGT2ABI3: 49 210 388–49 224 184, framåt-strängABI3PHOSPHO1: 49 223 346–49 230 831, bakåt-strängPHOSPHO1Diagram över HOXB13: 2 exoner på bakåt-strängen av kromosom 17Exon 2: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 1: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 2: 48 724 763–48 727 043, 2 281 baserExon 1: 48 727 993–48 728 750, 758 baser215′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 3 kb av genens 4 kb, och 855 av dessa baser kodar för proteinet.

Sekvensering av HOXB13

3Låg

Hur svår HOXB13 är att sekvensera med korta läsningar, av 100

  • Mappbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Upprepningar2,1 %
  • GC-innehåll27 %
  • Referenstäckning0 %

2

positioner i HOXB13 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.

Ett helgenomsekvensering täcker alla 4 kb av HOXB13, inklusive introner, inte bara de 3 kb exoner.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
  • ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
  • Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
  • Dataversion 2026.10.17-8666dff2.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). HOXB13-genen: homeobox B13. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/hoxb13

Vancouver

Dante Labs. HOXB13-genen: homeobox B13 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/hoxb13

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test