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Gene

HOXB13

homeobox B13

Sintesi

Localizzazione citogenetica
17q21.32
Coordinate
Cromosoma 17: 48.724.763–48.728.750 (GRCh38)
Esoni
2 esoni su 4 kb
Proteina
284 amminoacidi
Trascritto MANE Select
ENST00000290295.8NM_006361.6
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Report curato rilevante per questo gene

  • Tumore della prostata ereditario

    • Tumore della prostata
      • 2 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
      Cosa cambia sapendolo

      Screening precoce del PSA a partire dai 40 anni, terapia con inibitori di PARP per i portatori di varianti in BRCA2, test a cascata, adeguamento del protocollo di sorveglianza

Struttura di HOXB13

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
Cromosoma 17, con una parentesi dove si trova HOXB13. HOXB13 e 23 geni nelle vicinanze sul cromosoma 17, da 48.226.757 a 49.226.756.Cromosoma 1717q21.32p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.348,4 Mb48,6 Mb48,8 Mb49 Mb49,2 MbSKAP1: 48.133.433–48.430.275, filamento inversoSKAP1HOXB1: 48.528.526–48.531.011, filamento inversoHOXB1HOXB2: 48.540.894–48.545.115, filamento inversoHOXB2HOXB3: 48.548.870–48.604.912, filamento inversoHOXB4: 48.575.507–48.578.429, filamento inversoHOXB5: 48.591.257–48.594.179, filamento inversoHOXB6: 48.595.525–48.605.011, filamento inversoHOXB6HOXB7: 48.607.222–48.633.572, filamento inversoHOXB7HOXB8: 48.611.377–48.618.003, filamento inversoHOXB8HOXB9: 48.621.156–48.626.576, filamento inversoHOXB9PRAC2: 48.720.813–48.724.767, filamento direttoPRAC2PRAC1: 48.721.719–48.723.082, filamento inversoPRAC1HOXB13: 48.724.763–48.728.750, filamento inversoHOXB13TTLL6: 48.762.234–48.817.229, filamento inversoTTLL6CALCOCO2: 48.830.971–48.872.910, filamento direttoCALCOCO2ATP5MC1: 48.892.765–48.895.875, filamento direttoATP5MC1UBE2Z: 48.908.368–48.929.062, filamento direttoUBE2ZSNF8: 48.928.972–48.944.842, filamento inversoSNF8GIP: 48.958.554–48.968.596, filamento inversoGIPIGF2BP1: 48.997.225–49.056.148, filamento direttoIGF2BP1B4GALNT2: 49.132.460–49.178.647, filamento direttoB4GALNT2GNGT2: 49.202.791–49.210.610, filamento inversoGNGT2ABI3: 49.210.388–49.224.184, filamento direttoABI3PHOSPHO1: 49.223.346–49.230.831, filamento inversoPHOSPHO1Diagramma di HOXB13: 2 esoni sul filamento inverso del cromosoma 17Esone 2: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 1: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 2: 48.724.763–48.727.043, 2281 basiEsone 1: 48.727.993–48.728.750, 758 basi215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3 kb dei 4 kb del gene; 855 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge HOXB13

2

posizioni in HOXB13 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 4 kb di HOXB13, introni inclusi, non solo i 3 kb di esoni.

Link esterni

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
  • La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene HOXB13: homeobox B13. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/hoxb13

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Dante Labs. Gene HOXB13: homeobox B13 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/hoxb13

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