Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

PACSIN3

protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
11p11.2
Koordinaadid
Kromosoom 11: 47 177 522–47 186 434 (GRCh38)
Eksonid
11 eksonit, ulatus 8,9 kb
Valk
424 aminohapet
Tuntud ka kui
SDPIII
MANE Select transkript
ENST00000298838.11NM_016223.5
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni PACSIN3 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas PACSIN3 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 11, millel on sulg kohal, kus asub PACSIN3. PACSIN3 ja sellele lähedal asuvad 24 geeni kromosoomil 11, vahemikus 46 681 978 kuni 47 681 977.Kromosoom 1111p11.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2546,8 Mb47 Mb47,2 Mb47,4 Mb47,6 MbARHGAP1: 46 677 075–46 700 977, pöördne ahelARHGAP1ZNF408: 46 701 011–46 705 913, otsene ahelZNF408F2: 46 719 079–46 768 566, otsene ahelF2CKAP5: 46 742 768–46 846 308, pöördne ahelCKAP5LRP4: 46 856 717–46 918 642, pöördne ahelLRP4CSTPP1: 46 936 689–47 165 535, otsene ahelCSTPP1ARFGAP2: 47 135 667–47 177 474, pöördne ahelARFGAP2PACSIN3: 47 177 522–47 186 434, pöördne ahelPACSIN3DDB2: 47 214 435–47 240 555, otsene ahelDDB2ACP2: 47 237 598–47 249 288, pöördne ahelACP2NR1H3: 47 248 300–47 269 131, otsene ahelNR1H3MADD: 47 269 161–47 330 038, otsene ahelMADDMYBPC3: 47 331 406–47 352 702, pöördne ahelMYBPC3SPI1: 47 354 860–47 409 369, pöördne ahelSPI1SLC39A13: 47 407 132–47 416 587, otsene ahelSLC39A13PSMC3: 47 418 765–47 426 488, pöördne ahelPSMC3RAPSN: 47 436 816–47 449 192, pöördne ahelRAPSNCELF1: 47 465 933–47 565 569, pöördne ahelCELF1NDUFS3: 47 565 336–47 584 565, otsene ahelNDUFS3PTPMT1: 47 565 430–47 573 461, otsene ahelPTPMT1KBTBD4: 47 572 196–47 578 982, pöördne ahelKBTBD4FAM180B: 47 586 207–47 589 195, otsene ahelC1QTNF4: 47 589 666–47 595 642, pöördne ahelMTCH2: 47 604 339–47 642 698, pöördne ahelAGBL2: 47 659 591–47 715 389, pöördne ahelAGBL2PACSIN3 skeem: 11 eksonit kromosoomi 11 pöördne ahelalEkson 11: 47 177 522–47 178 046, 525 alustEkson 10: 47 178 366–47 178 487, 122 alustEkson 9: 47 178 894–47 179 030, 137 alustEkson 8: 47 179 159–47 179 279, 121 alustEkson 7: 47 179 411–47 179 586, 176 alustEkson 6: 47 180 186–47 180 341, 156 alustEkson 5: 47 180 455–47 180 690, 236 alustEkson 4: 47 182 403–47 182 559, 157 alustEkson 3: 47 182 674–47 182 764, 91 alustEkson 2: 47 183 004–47 183 069, 66 alustEkson 1: 47 186 349–47 186 434, 86 alust11109876543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,9 kb kogupikkusega 8,9 kb; neist 1275 alust kodeerivad valku.

PACSIN3 sekventeerimine

4Madal

Kui raske on PACSIN3 lühikeste lugemitega sekventeerida, skaalal 0–100

  • Kaardistatavus0%
  • Homoloogia0%
  • Kordused2,1%
  • GC-sisaldus40%
  • Viitekatvus0%

Geeniga PACSIN3 seotud tunnused

Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida PACSIN3 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). PACSIN3 geen: protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/pacsin3

Vancouver

Dante Labs. PACSIN3 geen: protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/pacsin3

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test