AtlasΓονίδιο
DTNBP1
dystrobrevin binding protein 1
- HGNC 17328↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- Γονίδιο Ensembl ENSG00000047579↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
- NCBI Gene 84062↗(ανοίγει σε νέα καρτέλα)
Σύνοψη
- Κυτογενετική θέση
- 6p22.3
- Συντεταγμένες
- Χρωμόσωμα 6: 15.522.807–15.663.028 (GRCh38)
- Εξόνια
- 10 έξώνια σε 140,2 kb
- Πρωτεΐνη
- 351 αμινοξέα
- Γνωστό επίσης ως
- Dysbindin, My031, HPS7, DBND, BLOC1S8
- Μεταγράφημα MANE Select
- ENST00000344537.10NM_032122.5
- Τύπος locus
- Κωδικοποιητικά πρωτεΐνες
- Πολύ υψηλή
- Υψηλή
- Χαμηλή
- Πολύ χαμηλή
AtlasShare this page
Αυτή η σελίδα ως δεδομένα
Προσθέστε .json στη διεύθυνση της σελίδας ή ζητήστε application/json, για να τη διαβάσετε ως JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/dtnbp1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameΔιαβάστε το DTNBP1, και το υπόλοιπο γονιδίωμά σας, με μία εξέταση.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες
Αποκτήστε το Genome Test σαςΕπιμελημένη αναφορά που σχετίζεται με αυτό το γονίδιο
Σύνδρομο Hermansky-Pudlak
- Αυτοσωμικός υπολειπόμενος
Το σύνδρομο Hermansky-Pudlak (HPS) είναι μια πολυσυστηματική διαταραχή που χαρακτηρίζεται από οκουλοκουτάνειο αλβινισμό, διάθεση για αιμορραγία και, σε ορισμένες περιπτώσεις, ουδετεροπενία, πνευμονική ίνωση ή κοκκιωματώδη κολίτιδα. Το HPS περιλαμβάνει οκτώ γνωστές διαταραχές (HPS-1 έως HPS-8), οι περισσότερες από τις οποίες εμφανίζονται με το ίδιο κλινικό φαινότυπο, σε διαφορετικούς βαθμούς σοβαρότητας.
- Η ClinGen αξιολογεί τη σύνδεση ως οριστική
- 4 υποβολείς του GenCC την αξιολογούν ως οριστική ή ισχυρή
Πώς είναι διαταγμένο το DTNBP1
- Κωδικοποιούσα αλληλουχία
- Μη μεταφραζόμενη περιοχή
- Ιντρόνιο
- Κατεύθυνση μεταγραφής
- Γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο
- Περιοχές που τα σύντομα αναγνώσματα βρίσκουν δύσκολες
Εξόνια του μεταγράφηματος MANE Select του γονιδίου (έκδοση v1.5), από τα NCBI και το EMBL-EBI, στο γονιδίωμα αναφοράς GRCh38.
Ζώνες χρωμοσωμάτων από το ιδεόγραμμα GRCh38 του UCSC (2022-10-29).
Γειτονικά γονίδια από την έκδοση 116 του Ensembl, στο GRCh38.
Τα εξόνια αποτελούν 1,4 kb από τα 140,2 kb του γονιδίου· 1.056 από αυτές τις βάσεις κωδικοποιούν την πρωτεΐνη.
Αλληλούχηση του DTNBP1
4Εύκολο
Πόσο δύσκολο είναι να αλληλουχηθεί το DTNBP1 με σύντομα αναγνώσματα, από το 100
0 · Εύκολο100 · Δύσκολο
Σχεδόν όλα τα εξόνια του DTNBP1 βρίσκονται σε σημεία όπου τα σύντομα αναγνώσματα αντιστοιχίζονται καθαρά.
Τι προσθέτει: το ποσοστό των εξονίων του DTNBP1 σε κάθε είδος δύσκολης περιοχής
- ΧαρτογραφησιμότηταΤμήματα όπου αναγνώσματα των 100 ή 250 bp δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά, οπότε μια κλήση εκεί μπορεί να λείπει ή να είναι λανθασμένη. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 100.0%
- ΟμολογίαΤμηματικές διπλασιάσεις: αντίγραφα αλλού στο γονιδίωμα, όπως παραλόγοι και ψευδογονίδια, με ταυτότητα 90% ή μεγαλύτερη. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 60.0%
- Κοινό με το chrYΟι ψευδοαυτοσωμικές περιοχές και η περιοχή X-transposed, όπου τα chrX και chrY φέρουν την ίδια ή σχεδόν την ίδια αλληλουχία, οπότε ένα ανάγνωσμα από το ένα μπορεί να τοποθετηθεί στο άλλο. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 60.0%
- Κάλυψη αναφοράςΚενά στο κοντινό σύνθετο γονιδίωμα αναφοράς, όπου δεν υπάρχει αλληλουχία με την οποία τα αναγνώσματα μπορούν να ευθυγραμμιστούν. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 50.0%
- ΕπαναλήψειςTandem επαναλήψεις και σειρές από μία βάση, πάνω στις οποίες τα αναγνώσματα ολισθαίνουν και ενδέχεται να μην τις καλύπτουν πλήρως. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 30.3,8%
- Περιεκτικότητα σε GCΠαράθυρα με λιγότερο από 25% ή περισσότερο από 65% G και C, τα οποία η προετοιμασία της βιβλιοθήκης καλύπτει αραιά. Από μόνο του, ένα γονίδιο που βρίσκεται εξ ολοκλήρου σε αυτό το είδος περιοχής θα είχε βαθμολογία 20.16%
Βαθμολογία της Dante Labs από δική μας έρευνα, βασισμένη στους χάρτες δύσκολα αλληλουχούμενων περιοχών Genome in a Bottle του NIST.Πώς βαθμολογείταιΚάθε ράβδος είναι το ποσοστό των βάσεων των εξονίων του DTNBP1 σε αυτό το είδος δύσκολης περιοχής. Κάθε είδος μπορεί από μόνο του να κάνει ένα γονίδιο δύσκολο, και καθένα επιπλέον προσθέτει λιγότερο: 0 όταν καμία βάση δεν βρίσκεται σε κάποια, 100 όταν κάθε βάση βρίσκεται εκεί όπου τα αναγνώσματα δεν μπορούν να τοποθετηθούν μοναδικά.
6
θέσεις στο DTNBP1 όπου το ClinVar κατατάσσει μια αλλαγή ως παθογόνο ή πιθανώς παθογόνο
Καμία από αυτές δεν βρίσκεται σε περιοχή που τα σύντομα αναγνώσματα δυσκολεύονται να καλύψουν.
Ένα πλήρες γονιδίωμα καλύπτει και τα 140,2 kb του DTNBP1, συμπεριλαμβανομένων των intronic περιοχών, και όχι μόνο τα 1,4 kb των εξονίων.
Παθογόνες παραλλαγές ClinVar (6)
Οι παραλλαγές του DTNBP1 που το ClinVar κατατάσσει ως παθογόνες ή πιθανώς παθογόνες για οποιαδήποτε πάθηση, έχουν αξιολογηθεί από τουλάχιστον έναν υποβάλλοντα με κριτήρια, καθώς και οι πιο αξιολογημένες από αυτές. Είναι η δημόσια καταγραφή του ClinVar για το γονίδιο και σε καμία περίπτωση αποτέλεσμα.
- Παθογόνο 2
- Πιθανώς παθογόνο 4
| Παραλλαγή | Παθήσεις | Ταξινόμηση ClinVar | Κατάσταση αξιολόγησης |
|---|---|---|---|
| NM_032122.5(DTNBP1):c.1017_1020del (p.Glu340fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | Hermansky-Pudlak syndrome | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032122.5(DTNBP1):c.307C>T (p.Gln103Ter) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | Hermansky-Pudlak syndrome 7 | Παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032122.5(DTNBP1):c.872T>G (p.Leu291Ter) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | Hermansky-Pudlak syndrome 7 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032122.5(DTNBP1):c.502dup (p.Thr168fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | Hermansky-Pudlak syndrome 7 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032122.5(DTNBP1):c.448_449del (p.Met150fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | Hermansky-Pudlak syndrome | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
| NM_032122.5(DTNBP1):c.79_83del (p.Ser27fs) (ανοίγει σε νέα καρτέλα) | Hermansky-Pudlak syndrome 7 | Πιθανώς παθογόνο | ★★★★1 αστέρι από 4 παρέχονται κριτήρια, ένας υποβολέας |
Γονίδια που σχετίζονται με τις ίδιες παθήσεις
- AP3B1adaptor related protein complex 3 subunit beta 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- AP3D1adaptor related protein complex 3 subunit delta 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- BLOC1S3biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 3Μοιράζεται 1 πάθηση
- BLOC1S5biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 5Μοιράζεται 1 πάθηση
- BLOC1S6biogenesis of lysosomal organelles complex 1 subunit 6Μοιράζεται 1 πάθηση
- HPS1HPS1 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- HPS3HPS3 biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1Μοιράζεται 1 πάθηση
- HPS4HPS4 biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 2Μοιράζεται 1 πάθηση
- HPS5HPS5 biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 2Μοιράζεται 1 πάθηση
- HPS6HPS6 biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3Μοιράζεται 1 πάθηση
Χαρακτηριστικά που συνδέονται με το DTNBP1
Το Human Phenotype Ontology καταγράφει αυτά ως χαρακτηριστικά των σπάνιων παθήσεων που μπορεί να προκαλέσει το DTNBP1. Η σελίδα κάθε χαρακτηριστικού εμφανίζει τα άλλα γονίδια που συνδέονται με αυτό.
Εξωτερικοί σύνδεσμοι
Εγγραφές γονιδίου
Μεταγράφημα
Πρωτεΐνη
Από πού προέρχονται αυτά
- HGNC: το σύμβολο, το όνομα, τα άλλα σύμβολα και η θέση του γονιδίου.
- MANE Select v1.5, από NCBI και EMBL-EBI: το μεταγράφημα, τα εξόνιά του και η κωδικοποιούσα αλληλουχία.
- GenCC και ClinGen, έκδοση 2026-10-19: ποιες παθήσεις συνδέονται με το γονίδιο και πόσο ισχυρή είναι αυτή η σύνδεση.
- Η λίστα δευτερευόντων ευρημάτων του ACMG, SF v3.2.
- ClinVar και οι στρωματοποιήσεις GIAB: γνωστές θέσεις που προκαλούν νόσο, και οι περιοχές που οι βραχείες αναγνώσεις βρίσκουν δύσκολες.
- Οι στρωματοποιήσεις γονιδιώματος Genome in a Bottle, από το NIST: η βαθμολογία δυσκολίας αλληλούχισης.
- Το Human Phenotype Ontology, έκδοση 2026-09-01: τα χαρακτηριστικά που συνδέονται με το γονίδιο. Μάθετε περισσότερα στο hpo.jax.org.
- Έκδοση δεδομένων 2026.10.19-9814e911.
Παραπομπή σε αυτή τη σελίδα
Dante Labs. (χ.η.). Γονίδιο DTNBP1: dystrobrevin binding protein 1. Ανάκτηση 21 Οκτωβρίου 2026, από https://dantelabs.com/el/genes/dtnbp1
Dante Labs. Γονίδιο DTNBP1: dystrobrevin binding protein 1 [Internet]. [ανακτήθηκε 21 Οκτωβρίου 2026]. Διαθέσιμο από: https://dantelabs.com/el/genes/dtnbp1
AtlasΈνα τεστ. Απαντήσεις για όλη τη ζωή.
Από 449 $Δωρεάν αποστολή · Αποτελέσματα σε 6–8 εβδομάδες