Gen
SSBP1
single stranded DNA binding protein 1
- HGNC 11317↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000106028↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6742↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 7q34
- Souřadnice
- Chromozom 7: 141 738 358–141 750 488 (GRCh38)
- Exony
- 7 exonů na 12,1 kb
- Protein
- 148 aminokyselin
- Další názvy
- SSBP, mtSSB
- Transkript MANE Select
- ENST00000265304.11NM_003143.3
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SSBP1 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Hereditary Optic Neuropathy
- Hereditary Optic Atrophy
Inherited loss of optic nerve fibres, most often autosomal dominant optic atrophy caused by changes in OPA1, and including rarer types caused by OPA3, DNM1L, SSBP1 and other genes.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: silná
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je SSBP1 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 0,7 kb z 12,1 kb genu; 447 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SSBP1
2
pozic v genu SSBP1, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 12,1 kb genu SSBP1, včetně intronů, nikoli jen 0,7 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ACO2aconitase 2Sdílí 1 onemocnění
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Sdílí 1 onemocnění
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Sdílí 1 onemocnění
- DNM1Ldynamin 1LSdílí 1 onemocnění
- MT-ND1mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 1Sdílí 1 onemocnění
- MT-ND4mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 4Sdílí 1 onemocnění
- MT-ND5mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 5Sdílí 1 onemocnění
- MT-ND6mitochondrially encoded NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit 6Sdílí 1 onemocnění
- OPA1OPA1 mitochondrial dynamin like GTPaseSdílí 1 onemocnění
- OPA3outer mitochondrial membrane lipid metabolism regulator OPA3Sdílí 1 onemocnění
- RTN4IP1reticulon 4 interacting protein 1Sdílí 1 onemocnění
- TMEM126Atransmembrane protein 126ASdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s SSBP1
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SSBP1. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SSBP1: single stranded DNA binding protein 1. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/ssbp1
Dante Labs. Gen SSBP1: single stranded DNA binding protein 1 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/ssbp1
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů