Gen
NARS1
asparaginyl-tRNA synthetase 1
- HGNC 7643↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000134440↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 4677↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 18q21.31
- Koordinater
- Kromosom 18: 57 600 656–57 621 836 (GRCh38)
- Exoner
- 14 exoner på 21,2 kb
- Protein
- 548 aminosyror
- Även känd som
- AsnRS
- Tidigare symboler
- NARS
- MANE Select-transkript
- ENST00000256854.10NM_004539.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nars1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs NARS1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ingen Genome Test-rapport läser NARS1 ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.
Så är NARS1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,8 kb av genens 21,2 kb, och 1 647 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av NARS1
1Lätt
Hur svår NARS1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i NARS1 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som adderar: andelen av NARS1:s exoner i varje typ av svårt område
- MappbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, som läsningar glider på och som kanske inte spänner över. Vikt 15 %.2,2 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker tunnt. Vikt 10 %.1,7 %
- ReferenstäckningLuckor i referensassemblyn i närheten, där det inte finns någon sekvens för läsningar att anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
En poäng från Dante Labs egen forskning, byggd på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade områden.Så beräknas poängenVarje stapel är andelen av NARS1:s exonbaser i just den typen av svårt område. Varje typ kan i sig göra en gen svår, och varje ytterligare typ adderar mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
18
positioner i NARS1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller trolig patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsekvensering täcker alla 21,2 kb av NARS1, inklusive introner, inte bara de 2,8 kb exoner.
ClinVar pathogenic variants (18)
The NARS1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 2
- Patogen/sannolikt patogen 2
- Sannolikt patogen 14
| Variant | Conditions | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_004539.4(NARS1):c.1600C>T (p.Arg534Ter) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder and 2 others | Patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_004539.4(NARS1):c.1633C>T (p.Arg545Cys) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, and gait abnormalities | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_004539.4(NARS1):c.1564C>T (p.Arg522Ter) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, and gait abnormalities and 1 other | Patogen/sannolikt patogen | ★★★★2 stjärnor av 4 kriterier angivna, flera inlämnare, inga konflikter |
| NM_004539.4(NARS1):c.268C>T (p.Arg90Ter) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, and gait abnormalities | Patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.1460C>T (p.Ala487Val) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, epilepsy, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.1315C>T (p.Arg439Ter) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, epilepsy, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.1208A>T (p.His403Leu) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, epilepsy, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.1067A>C (p.Asp356Ala) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.986G>A (p.Arg329Gln) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.965G>T (p.Arg322Leu) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, epilepsy, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.901C>T (p.Gln301Ter) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.802-2A>G (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.713G>A (p.Arg238Gln) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.676G>C (p.Val226Leu) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.376C>T (p.Gln126Ter) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, epilepsy, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.277_278del (p.Lys93fs) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.179A>C (p.Lys60Thr) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
| NM_004539.4(NARS1):c.50C>T (p.Thr17Met) (opens in a new tab) | neurodevelopmental disorder with microcephaly, impaired language, and gait abnormalities | Sannolikt patogen | ★★★★1 stjärna av 4 kriterier angivna, en inlämnare |
Egenskaper kopplade till NARS1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som NARS1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Delayed ability to walk
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Delayed ability to sit
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Decreased reflex response
Visa ytterligare 16 egenskaper
- Impaired touch sensation
- Inability to coordinate movements when walking
- Increased reflexes
- Peripheral neuropathy
- Seizure affecting one half of brain
- Brain degeneration
- Cerebral white matter hypoplasia
- Delayed CNS myelination
- Fewer and broader ridges in brain
- Fluid-filled sac located in membrane surrounding brain or spinal cord
- Jerking
- Myoclonic seizure
- Repetitive movements
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Widened cerebral subarachnoid space
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). NARS1-genen: asparaginyl-tRNA synthetase 1. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/nars1
Dante Labs. NARS1-genen: asparaginyl-tRNA synthetase 1 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/nars1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor