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Gene

SYCP2

synaptonemal complex protein 2

Resumo

Localização citogenética
20q13.33
Coordenadas
Cromossoma 20: 59 863 571–59 933 637 (GRCh38)
Exões
45 exões ao longo de 70,1 kb
Proteína
1530 aminoácidos
Também conhecido como
SCP2
Transcrito MANE Select
ENST00000357552.8NM_014258.4
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Genoma de referênciaGRCh38

As posições nas páginas de genes e variantes seguem esta escolha, neste navegador.

Relatório com curadoria relevante para este gene

  • Infertilidade masculina

    • A incapacidade de o homem fecundar um óvulo após um período determinado de relações sexuais sem proteção. A esterilidade masculina é uma infertilidade permanente.

      • 1 submissor GenCC classifica-a como definitiva ou forte

Como SYCP2 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Locais conhecidos associados a doença
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 20, com um parêntese onde se situa SYCP2. SYCP2 e 4 genes próximos no cromossoma 20, de 59 398 604 a 60 398 603.Cromossoma 2020q13.33p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3359,4 Mb59,6 Mb59,8 Mb60 Mb60,2 MbPHACTR3: 59 577 470–59 847 711, fita diretaPHACTR3SYCP2: 59 863 571–59 933 637, fita inversaSYCP2FAM217B: 59 933 643–59 952 201, fita diretaFAM217BPPP1R3D: 59 936 663–59 940 305, fita inversaPPP1R3DCDH26: 59 958 421–60 034 011, fita diretaCDH26Diagrama de SYCP2: 45 exões na cadeia inversa do cromossoma 20Exão 20: 1 local conhecido associado a doençaExão 45: 59 863 571–59 864 388, 818 basesExão 44: 59 865 388–59 865 444, 57 basesExão 43: 59 865 573–59 865 651, 79 basesExão 42: 59 865 807–59 865 865, 59 basesExão 41: 59 866 293–59 866 392, 100 basesExão 40: 59 866 495–59 866 589, 95 basesExão 39: 59 867 711–59 867 847, 137 basesExão 38: 59 868 413–59 868 568, 156 basesExão 37: 59 868 835–59 868 925, 91 basesExão 36: 59 869 798–59 869 983, 186 basesExão 35: 59 873 856–59 874 061, 206 basesExão 34: 59 875 271–59 875 469, 199 basesExão 33: 59 877 385–59 877 555, 171 basesExão 32: 59 878 008–59 878 045, 38 basesExão 31: 59 880 303–59 880 471, 169 basesExão 30: 59 880 966–59 881 023, 58 basesExão 29: 59 881 437–59 881 492, 56 basesExão 28: 59 881 945–59 882 002, 58 basesExão 27: 59 882 095–59 882 165, 71 basesExão 26: 59 885 928–59 885 964, 37 basesExão 25: 59 886 707–59 886 834, 128 basesExão 24: 59 891 990–59 892 426, 437 basesExão 23: 59 892 568–59 892 701, 134 basesExão 22: 59 893 142–59 893 199, 58 basesExão 21: 59 893 524–59 893 593, 70 basesExão 20: 59 895 437–59 895 597, 161 basesExão 19: 59 896 429–59 896 528, 100 basesExão 18: 59 900 138–59 900 284, 147 basesExão 17: 59 900 744–59 900 818, 75 basesExão 16: 59 901 662–59 901 810, 149 basesExão 15: 59 907 364–59 907 424, 61 basesExão 14: 59 911 750–59 911 845, 96 basesExão 13: 59 912 373–59 912 418, 46 basesExão 12: 59 913 975–59 914 027, 53 basesExão 11: 59 914 109–59 914 251, 143 basesExão 10: 59 915 165–59 915 199, 35 basesExão 9: 59 915 465–59 915 550, 86 basesExão 8: 59 916 486–59 916 571, 86 basesExão 7: 59 919 158–59 919 182, 25 basesExão 6: 59 919 493–59 919 597, 105 basesExão 5: 59 920 359–59 920 487, 129 basesExão 4: 59 921 310–59 921 453, 144 basesExão 3: 59 922 390–59 922 459, 70 basesExão 2: 59 932 062–59 932 154, 93 basesExão 1: 59 933 569–59 933 637, 69 bases4540353025201510515′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 5,5 kb dos 70,1 kb do gene; 4593 dessas bases codificam a proteína.

Como um teste de genoma lê SYCP2

2

posições em SYCP2 onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica

Nenhuma delas se situa numa região onde as leituras curtas têm dificuldade.

Um genoma completo abrange todos os 70,1 kb de SYCP2, incluindo os intrões, e não apenas os 5,5 kb de exões.

De onde vem esta informação

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • GenCC e ClinGen, publicado em 2026-10-16: as condições a que o gene está associado e o grau dessa associação.
  • A lista ACMG de achados secundários, SF v3.2.
  • ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos associados a doenças e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
  • Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
  • Versão dos dados 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene SYCP2: synaptonemal complex protein 2. Consultado em 17 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/sycp2

Vancouver

Dante Labs. Gene SYCP2: synaptonemal complex protein 2 [Internet]. [consultado em 17 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/sycp2

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