Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA

Gen

SYCP2

synaptonemal complex protein 2

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
20q13.33
Koordinater
Kromosom 20: 59 863 571–59 933 637 (GRCh38)
Eksoner
45 eksoner over 70,1 kb
Protein
1 530 aminosyrer
Også kjent som
SCP2
MANE Select-transkripsjon
ENST00000357552.8NM_014258.4
Lokustype
gene with protein product
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

ReferansegenomGRCh38

Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.

Kuratert rapport som er relevant for dette genet

  • Mannlig infertilitet

    • Mannens manglende evne til å befrukte en eggcelle etter en bestemt periode med ubeskyttet samleie. Mannlig sterilitet er varig infertilitet.

      • 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk

Slik er SYCP2 bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 20, med en parentes der SYCP2 står. SYCP2 og 4 gener i nærheten på kromosom 20, fra 59 398 604 til 60 398 603.Kromosom 2020q13.33p13p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.3359,4 Mb59,6 Mb59,8 Mb60 Mb60,2 MbPHACTR3: 59 577 470–59 847 711, fremover-strengPHACTR3SYCP2: 59 863 571–59 933 637, bakover-strengSYCP2FAM217B: 59 933 643–59 952 201, fremover-strengFAM217BPPP1R3D: 59 936 663–59 940 305, bakover-strengPPP1R3DCDH26: 59 958 421–60 034 011, fremover-strengCDH26Diagram av SYCP2: 45 eksoner på bakover-strengen til kromosom 20Ekson 20: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 45: 59 863 571–59 864 388, 818 baserEkson 44: 59 865 388–59 865 444, 57 baserEkson 43: 59 865 573–59 865 651, 79 baserEkson 42: 59 865 807–59 865 865, 59 baserEkson 41: 59 866 293–59 866 392, 100 baserEkson 40: 59 866 495–59 866 589, 95 baserEkson 39: 59 867 711–59 867 847, 137 baserEkson 38: 59 868 413–59 868 568, 156 baserEkson 37: 59 868 835–59 868 925, 91 baserEkson 36: 59 869 798–59 869 983, 186 baserEkson 35: 59 873 856–59 874 061, 206 baserEkson 34: 59 875 271–59 875 469, 199 baserEkson 33: 59 877 385–59 877 555, 171 baserEkson 32: 59 878 008–59 878 045, 38 baserEkson 31: 59 880 303–59 880 471, 169 baserEkson 30: 59 880 966–59 881 023, 58 baserEkson 29: 59 881 437–59 881 492, 56 baserEkson 28: 59 881 945–59 882 002, 58 baserEkson 27: 59 882 095–59 882 165, 71 baserEkson 26: 59 885 928–59 885 964, 37 baserEkson 25: 59 886 707–59 886 834, 128 baserEkson 24: 59 891 990–59 892 426, 437 baserEkson 23: 59 892 568–59 892 701, 134 baserEkson 22: 59 893 142–59 893 199, 58 baserEkson 21: 59 893 524–59 893 593, 70 baserEkson 20: 59 895 437–59 895 597, 161 baserEkson 19: 59 896 429–59 896 528, 100 baserEkson 18: 59 900 138–59 900 284, 147 baserEkson 17: 59 900 744–59 900 818, 75 baserEkson 16: 59 901 662–59 901 810, 149 baserEkson 15: 59 907 364–59 907 424, 61 baserEkson 14: 59 911 750–59 911 845, 96 baserEkson 13: 59 912 373–59 912 418, 46 baserEkson 12: 59 913 975–59 914 027, 53 baserEkson 11: 59 914 109–59 914 251, 143 baserEkson 10: 59 915 165–59 915 199, 35 baserEkson 9: 59 915 465–59 915 550, 86 baserEkson 8: 59 916 486–59 916 571, 86 baserEkson 7: 59 919 158–59 919 182, 25 baserEkson 6: 59 919 493–59 919 597, 105 baserEkson 5: 59 920 359–59 920 487, 129 baserEkson 4: 59 921 310–59 921 453, 144 baserEkson 3: 59 922 390–59 922 459, 70 baserEkson 2: 59 932 062–59 932 154, 93 baserEkson 1: 59 933 569–59 933 637, 69 baser4540353025201510515′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 5,5 kb av genets 70,1 kb, og 4 593 av disse basene koder for proteinet.

Slik leser en genetisk test SYCP2

2

posisjoner i SYCP2 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen

Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.

En helgenomsekvensering dekker alle 70,1 kb av SYCP2, inkludert introner, og ikke bare de 5,5 kb med eksoner.

Hvor dette kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
  • GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
  • ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
  • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
  • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
  • Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). SYCP2-genet: synaptonemal complex protein 2. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/sycp2

Vancouver

Dante Labs. SYCP2-genet: synaptonemal complex protein 2 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/sycp2

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test