Gene
LOXHD1
lipoxygenase homology PLAT domains 1
- HGNC 26521↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000167210↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 125336↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 18q21.1
- Coordenadas
- Cromossoma 18: 46 477 273–46 657 220 (GRCh38)
- Exões
- 41 exões ao longo de 179,9 kb
- Proteína
- 2273 aminoácidos
- Também conhecido como
- FLJ32670, LH2D1
- Símbolos anteriores
- DFNB77
- Transcrito MANE Select
- ENST00000642948.1NM_001384474.1
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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url <- "https://dantelabs.com/genes/loxhd1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameAnalise LOXHD1, e o resto do seu genoma, com um único teste.
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Perda Auditiva e Surdez
- Perda Auditiva Genética Não Sindrómica
Um de 97 genes ligados a este
Perda auditiva hereditária sem outras manifestações clínicas, incluindo as formas recessivas mais comuns causadas por GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC e muitos outros genes, bem como as formas dominantes, ligadas ao cromossoma X e mitocondriais.
- O ClinGen classifica a associação como definitiva
- 6 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
▶Acionabilidade
Conhecer a causa genética pode orientar o apoio auditivo e as decisões sobre implante coclear, a elegibilidade para ensaios de terapia genética (por exemplo, OTOF) e o aconselhamento familiar.
Como LOXHD1 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Locais conhecidos associados a doença
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 7,2 kb dos 179,9 kb do gene; 6822 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de LOXHD1
270
posições em LOXHD1 onde o ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica
Nenhuma delas se situa numa região que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
Um genoma completo cobre todos os 179,9 kb de LOXHD1, incluindo os intrões, e não apenas os 7,2 kb de exões.
ClinVar pathogenic variants (286)
The LOXHD1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogénica 69
- Patogénica/provavelmente patogénica 19
- Provavelmente patogénica 198
| Variante | Conditions | Classificação na ClinVar | Estado de revisão |
|---|---|---|---|
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.6074del (p.Gly2025fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.5895G>A (p.Trp1965Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.4480C>T (p.Arg1494Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 and 1 other | Patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.4099G>T (p.Glu1367Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.3061C>T (p.Arg1021Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.2863G>T (p.Glu955Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.2008C>T (p.Arg670Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.894T>G (p.Tyr298Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.6539G>A (p.Gly2180Glu) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 and 1 other | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.6130C>T (p.Arg2044Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.6050-2A>C (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.5734G>T (p.Glu1912Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.5330del (p.Asn1777fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 and 1 other | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.4936C>T (p.Arg1646Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.4794_4795insTC (p.Ile1599fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.4714C>T (p.Arg1572Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.4595_4605del (p.Asp1532fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.4282C>T (p.Arg1428Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.4212+1G>A (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.3924C>A (p.Tyr1308Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.3061+1G>A (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 and 2 others | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.2497C>T (p.Arg833Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 and 1 other | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.2377C>T (p.Gln793Ter) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.1537_1538del (p.Leu513fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 and 1 other | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_001384474.1(LOXHD1):c.1072_1073del (p.Leu358fs) (opens in a new tab) | autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 77 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
See all 286 with every other LOXHD1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Genes associados às mesmas condições
- ACTG1actin gamma 1Partilha 1 condição
- AFG2BAAA ATPase AFG2BPartilha 1 condição
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Partilha 1 condição
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11APartilha 1 condição
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Partilha 1 condição
- CABP2calcium binding protein 2Partilha 1 condição
- CD164CD164 moleculePartilha 1 condição
- CDC14Acell division cycle 14APartilha 1 condição
- CDH23cadherin related 23Partilha 1 condição
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentPartilha 1 condição
- CIB2calcium and integrin binding family member 2Partilha 1 condição
- CLDN14claudin 14Partilha 1 condição
Características associadas a LOXHD1
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que LOXHD1 pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- GenCC e ClinGen, publicados em 2026-10-18: as condições a que o gene está associado e a força dessa associação.
- A lista de achados secundários do ACMG, SF v3.2.
- ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos que causam doença e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão de dados 2026.10.18-8b139e39.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene LOXHD1: lipoxygenase homology PLAT domains 1. Consultado em 19 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/loxhd1
Dante Labs. Gene LOXHD1: lipoxygenase homology PLAT domains 1 [Internet]. [consultado em 19 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/loxhd1
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