Gen
LOXHD1
lipoxygenase homology PLAT domains 1
- HGNC 26521↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000167210↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 125336↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 18q21.1
- Coördinaten
- Chromosoom 18: 46.477.273–46.657.220 (GRCh38)
- Exons
- 41 exons over 179,9 kb
- Eiwit
- 2.273 aminozuren
- Ook bekend als
- FLJ32670, LH2D1
- Eerdere symbolen
- DFNB77
- MANE Select-transcript
- ENST00000642948.1NM_001384474.1
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/loxhd1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees LOXHD1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Gehoorverlies en doofheid
- Niet-syndromale erfelijke gehoorstoornis
Een van 97 genen die hiermee verband houden
Erfelijk gehoorverlies zonder andere medische kenmerken, inclusief de veelvoorkomende recessieve vormen veroorzaakt door GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC en vele andere genen, evenals dominante, X-gebonden en mitochondriale vormen.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 6 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Het kennen van de genetische oorzaak kan helpen bij keuzes rond gehoorondersteuning en cochleaire implantaten, bij de geschiktheid voor deelname aan onderzoeken naar genetherapie (bijvoorbeeld bij OTOF) en bij erfelijkheidsadvies voor familieleden.
Opbouw van LOXHD1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 7,2 kb van de 179,9 kb van het gen; 6.822 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van LOXHD1
270
posities in LOXHD1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 179,9 kb van LOXHD1, inclusief intronen, en niet alleen de 7,2 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ACTG1actin gamma 1Deelt 1 aandoening
- AFG2BAAA ATPase AFG2BDeelt 1 aandoening
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Deelt 1 aandoening
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11ADeelt 1 aandoening
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Deelt 1 aandoening
- CABP2calcium binding protein 2Deelt 1 aandoening
- CD164CD164 moleculeDeelt 1 aandoening
- CDC14Acell division cycle 14ADeelt 1 aandoening
- CDH23cadherin related 23Deelt 1 aandoening
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentDeelt 1 aandoening
- CIB2calcium and integrin binding family member 2Deelt 1 aandoening
- CLDN14claudin 14Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan LOXHD1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die LOXHD1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). LOXHD1-gen: lipoxygenase homology PLAT domains 1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/loxhd1
Dante Labs. LOXHD1-gen: lipoxygenase homology PLAT domains 1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/loxhd1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken